Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.12□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 NCE101YJL205C 162 nt2.12□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 NOP14YDL148C 2433 nt2.11□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 UBP2YOR124C 3819 nt2.11□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 NIC96YFR002W 2520 nt2.11□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 CDC50YCR094W 1176 nt2.11□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 RPL9AYGL147C 576 nt2.11□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.11□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt2.11□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 BFA1YJR053W 1725 nt2.11□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 USO1YDL058W 5373 nt2.1□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 SPO22YIL073C 2928 nt2.1□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 BNA7YDR428C 786 nt2.1□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 MZM1YDR493W 372 nt2.1□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 MTC7YEL033W 420 nt2.1□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 SNC1YAL030W 354 nt2.1□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 SEN15YMR059W 387 nt2.1□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 YNL010WYNL010W 726 nt2.1□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 YOR333CYOR333C 417 nt2.1□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 Q0017Q0017 162 nt2.1□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 BUD2YKL092C 3315 nt2.09□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 VPS8YAL002W 3825 nt2.09□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 UBP1YDL122W 2430 nt2.09□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 RUD3YOR216C 1455 nt2.09□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 KOG1YHR186C 4674 nt2.09□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 YDR286CYDR286C 345 nt2.09□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 YAP3YHL009C 993 nt2.09□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 YJR079WYJR079W 330 nt2.09□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 RMP1YLR145W 606 nt2.09□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 CTK3YML112W 891 nt2.09□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 RPB5YBR154C 648 nt2.09□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.09□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.09□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.09□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 RTT101YJL047C 2529 nt2.09□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 VPH1YOR270C 2523 nt2.09□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 SPC72YAL047C 1869 nt2.08□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 VPS35YJL154C 2835 nt2.08□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 YPS5YGL259W 498 nt2.08□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 Q0144Q0144 330 nt2.08□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.08□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 RPI1YIL119C 1224 nt2.08□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt2.08□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 YLR031WYLR031W 561 nt2.08□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 IRC16YPR038W 360 nt2.08□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 MNE1YOR350C 1992 nt2.08□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 SWT1YOR166C 1377 nt2.08□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 SEC31YDL195W 3822 nt2.08□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 CRM1YGR218W 3255 nt2.07□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 YJL016WYJL016W 1686 nt2.07□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.07□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.07□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.07□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 SLM6YBR266C 453 nt2.07□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 GRR1YJR090C 3456 nt2.07□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 TRL1YJL087C 2484 nt2.07□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 MGM1YOR211C 2646 nt2.06□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 ATG9YDL149W 2994 nt2.06□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 YKL111CYKL111C 336 nt2.06□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.06□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 RRF1YHR038W 693 nt2.05□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 IRC19YLL033W 693 nt2.05□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 PKR1YMR123W 369 nt2.05□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 MRPL44YMR225C 297 nt2.05□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 YNL122CYNL122C 348 nt2.05□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 TOR2YKL203C 7425 nt2.05□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 SCH9YHR205W 2475 nt2.05□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 SMB1YER029C 591 nt2.04□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 RPC10YHR143W-A 213 nt2.04□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 VPS52YDR484W 1926 nt2.03□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 HOP2YGL033W 657 nt2.03□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 YGR045CYGR045C 363 nt2.03□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 RPL16AYIL133C 600 nt2.03□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 YMR324CYMR324C 243 nt2.03□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 PBI2YNL015W 228 nt2.03□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 SNC2YOR327C 348 nt2.03□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 RTC6YPL183W-A 282 nt2.03□□□□□ -2.08
VPS54Q12071 GUP1YGL084C 1683 nt2.02□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 SOK2YMR016C 2358 nt2.02□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 YDL041WYDL041W 354 nt2.02□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.02□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.02□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 BIG1YHR101C 1008 nt2.02□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 YKR051WYKR051W 1257 nt2.02□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 YLR053CYLR053C 327 nt2.02□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 RIC1YLR039C 3171 nt2.02□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 ELG1YOR144C 2376 nt2.02□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 GCN2YDR283C 4980 nt2.01□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 NEO1YIL048W 3456 nt2.01□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 PDR8YLR266C 2106 nt2.01□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 SEC22YLR268W 645 nt2.01□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 GPI15YNL038W 690 nt2.01□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 YOR248WYOR248W 303 nt2.01□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 SET2YJL168C 2202 nt2.01□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 IRC10YOL015W 1761 nt2□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 CDC60YPL160W 3273 nt2□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 CDC27YBL084C 2277 nt2□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 MXR1YER042W 555 nt2□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 YGR290WYGR290W 444 nt2□□□□□ -2.09
VPS54Q12071 YHR130CYHR130C 336 nt2□□□□□ -2.09
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