Protein–RNA interactions for Protein: Q08109

HRD1, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase HRD1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1Q08109 ATC1YDR184C 885 nt1.02□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 MSN5YDR335W 3675 nt1.02□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 GEP7YGL057C 864 nt1.02□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 YNL179CYNL179C 438 nt1.02□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 NDD1YOR372C 1665 nt1.02□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 SPT7YBR081C 3999 nt1.01□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 SRB7YDR308C 423 nt1.01□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 MTC7YEL033W 420 nt1.01□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.01□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 BTN2YGR142W 1233 nt1.01□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 RPL34BYIL052C 366 nt1.01□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 YJL022WYJL022W 309 nt1.01□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 VPS55YJR044C 423 nt1.01□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 TIF11YMR260C 462 nt1.01□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 NOP15YNL110C 663 nt1.01□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 YOR152CYOR152C 771 nt1.01□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 MGE1YOR232W 687 nt1.01□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 EGD1YPL037C 474 nt1.01□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 CDC27YBL084C 2277 nt1.01□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 IPI3YNL182C 1668 nt1□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 APM3YBR288C 1452 nt1□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 NGG1YDR176W 2109 nt1□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 MSC6YOR354C 2079 nt1□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 MNL2YLR057W 2550 nt1□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 FSH1YHR049W 732 nt1□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 PGA1YNL158W 597 nt1□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 SPE1YKL184W 1401 nt0.99□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 SPT14YPL175W 1359 nt0.99□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 YJR029WYJR029W 5268 nt0.99□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.99□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 YAL064WYAL064W 285 nt0.99□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 CTK3YML112W 891 nt0.99□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt0.99□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 ZRG8YER033C 3231 nt0.99□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 RSM23YGL129C 1353 nt0.98□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 ROM2YLR371W 4071 nt0.98□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt0.98□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 NTF2YER009W 378 nt0.98□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 RPL22BYFL034C-A 369 nt0.98□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 IRC19YLL033W 693 nt0.98□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 RPB11YOL005C 363 nt0.98□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 BRO1YPL084W 2535 nt0.98□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 AZF1YOR113W 2745 nt0.97□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 YLR149CYLR149C 2193 nt0.97□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 YGR250CYGR250C 2346 nt0.97□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 TMA20YER007C-A 546 nt0.97□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 SVP26YHR181W 687 nt0.97□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.97□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.97□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 IST3YIR005W 447 nt0.97□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 YJL086CYJL086C 369 nt0.97□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 RPS30AYLR287C-A 192 nt0.97□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 YPL034WYPL034W 498 nt0.97□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 YBR287WYBR287W 1284 nt0.97□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 IRR1YIL026C 3453 nt0.97□□□□□ -2.25
HRD1Q08109 YCS4YLR272C 3531 nt0.96□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt0.96□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 YDL009CYDL009C 324 nt0.96□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.96□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.96□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.96□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 OST5YGL226C-A 261 nt0.96□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 GIC1YHR061C 945 nt0.96□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 PEP8YJL053W 1140 nt0.96□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 YJL119CYJL119C 324 nt0.96□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 RPS16AYMR143W 432 nt0.96□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 ROX1YPR065W 1107 nt0.96□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 YPR146CYPR146C 330 nt0.96□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 IML1YJR138W 4755 nt0.96□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 MUD2YKL074C 1584 nt0.96□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 DCP2YNL118C 2913 nt0.95□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 YGL042CYGL042C 306 nt0.95□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 THG1YGR024C 714 nt0.95□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 COF1YLL050C 432 nt0.95□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 YLR302CYLR302C 363 nt0.95□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt0.95□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 YOR105WYOR105W 327 nt0.95□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 RIC1YLR039C 3171 nt0.94□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 YCR016WYCR016W 873 nt0.94□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 YCR043CYCR043C 384 nt0.94□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 YDR248CYDR248C 582 nt0.94□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 GPX1YKL026C 504 nt0.94□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 MVP1YMR004W 1536 nt0.94□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 DGR2YKL121W 2559 nt0.94□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 SIP4YJL089W 2490 nt0.93□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 VOA1YGR106C 798 nt0.93□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 ABM1YJR108W 372 nt0.93□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 YNL114CYNL114C 372 nt0.93□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 SNC2YOR327C 348 nt0.93□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 ATP15YPL271W 189 nt0.93□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 YPR063CYPR063C 423 nt0.93□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 RMD6YEL072W 696 nt0.92□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 PAI3YMR174C 207 nt0.92□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 SUS1YBR111W-A 291 nt0.92□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 RLM1YPL089C 2031 nt0.91□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt0.91□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 LAG1YHL003C 1236 nt0.91□□□□□ -2.26
HRD1Q08109 YLR031WYLR031W 561 nt0.91□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 41.5 ms