Protein–RNA interactions for Protein: Q07457

BRE1, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRE1Q07457 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.76□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 ATP17YDR377W 306 nt2.76□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.76□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 AAD16YFL057C 459 nt2.76□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 YLR458WYLR458W 381 nt2.76□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 ICY1YMR195W 384 nt2.76□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt2.76□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 RRP12YPL012W 3687 nt2.76□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 YEL057CYEL057C 702 nt2.75□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.75□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 CMC2YBL059C-A 330 nt2.75□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 YSW1YBR148W 1830 nt2.75□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 YPR097WYPR097W 3222 nt2.74□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 snR56snR56 88 nt2.74□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 YER135CYER135C 393 nt2.74□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.74□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 IRC19YLL033W 693 nt2.74□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 CCW14YLR390W-A 717 nt2.74□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 YNL010WYNL010W 726 nt2.74□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 CDC33YOL139C 642 nt2.74□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 ATP3YBR039W 936 nt2.74□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 ATP15YPL271W 189 nt2.74□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 YPR039WYPR039W 336 nt2.74□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 NIC96YFR002W 2520 nt2.74□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 AFI1YOR129C 2682 nt2.74□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 APL5YPL195W 2799 nt2.73□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 STH1YIL126W 4080 nt2.73□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 NUP82YJL061W 2142 nt2.73□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 TEN1YLR010C 483 nt2.73□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 RPS17AYML024W 411 nt2.73□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 snR13snR13 124 nt2.73□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 RSA1YPL193W 1146 nt2.73□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 MZM1YDR493W 372 nt2.72□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 YGR025WYGR025W 303 nt2.72□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 YLR031WYLR031W 561 nt2.72□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 PEX17YNL214W 600 nt2.72□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 YBL108WYBL108W 306 nt2.72□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 MSS18YPR134W 807 nt2.72□□□□□ -1.97
BRE1Q07457 PTC5YOR090C 1719 nt2.71□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 VOA1YGR106C 798 nt2.71□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 AYR1YIL124W 894 nt2.71□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.71□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 UBP11YKR098C 2154 nt2.71□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 YJL181WYJL181W 1836 nt2.7□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 MSL5YLR116W 1431 nt2.7□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 YBR277CYBR277C 402 nt2.7□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 SNX41YDR425W 1878 nt2.7□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 MSS11YMR164C 2277 nt2.7□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 INO80YGL150C 4470 nt2.69□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 NCL1YBL024W 2055 nt2.69□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 FMP16YDR070C 282 nt2.69□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 RPL40AYIL148W 387 nt2.69□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 YML084WYML084W 309 nt2.69□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 COX7YMR256C 183 nt2.69□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 YOR392WYOR392W 444 nt2.69□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 LEE1YPL054W 906 nt2.69□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 SAP190YKR028W 3102 nt2.69□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.68□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 YFR056CYFR056C 369 nt2.68□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt2.68□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 NCE101YJL205C 162 nt2.68□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 YPR012WYPR012W 255 nt2.68□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 MLH1YMR167W 2310 nt2.68□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 TOR1YJR066W 7413 nt2.68□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 RRP6YOR001W 2202 nt2.67□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 SEC16YPL085W 6588 nt2.67□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 ZEO1YOL109W 342 nt2.67□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 YOL159CYOL159C 516 nt2.67□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 REV1YOR346W 2958 nt2.67□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 TUS1YLR425W 3924 nt2.67□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 VPS52YDR484W 1926 nt2.66□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 SPF1YEL031W 3648 nt2.66□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 CLN3YAL040C 1743 nt2.66□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 YER068C-AYER068C-A 432 nt2.66□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 VTC1YER072W 390 nt2.66□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 CRG1YHR209W 876 nt2.66□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 TMA10YLR327C 261 nt2.66□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.66□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 VTI1YMR197C 654 nt2.66□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 IRA2YOL081W 9240 nt2.66□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 RAV1YJR033C 4074 nt2.66□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 UBP15YMR304W 3693 nt2.65□□□□□ -1.98
BRE1Q07457 IRC10YOL015W 1761 nt2.65□□□□□ -1.99
BRE1Q07457 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt2.65□□□□□ -1.99
BRE1Q07457 YDR269CYDR269C 324 nt2.65□□□□□ -1.99
BRE1Q07457 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.65□□□□□ -1.99
BRE1Q07457 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.65□□□□□ -1.99
BRE1Q07457 YLR334CYLR334C 381 nt2.65□□□□□ -1.99
BRE1Q07457 IST2YBR086C 2841 nt2.65□□□□□ -1.99
BRE1Q07457 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.64□□□□□ -1.99
BRE1Q07457 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt2.64□□□□□ -1.99
BRE1Q07457 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.64□□□□□ -1.99
BRE1Q07457 SOK2YMR016C 2358 nt2.64□□□□□ -1.99
BRE1Q07457 TFC3YAL001C 3483 nt2.63□□□□□ -1.99
BRE1Q07457 PRK1YIL095W 2433 nt2.63□□□□□ -1.99
BRE1Q07457 TAE2YPL009C 3117 nt2.63□□□□□ -1.99
BRE1Q07457 UBR1YGR184C 5853 nt2.63□□□□□ -1.99
BRE1Q07457 YDL041WYDL041W 354 nt2.63□□□□□ -1.99
BRE1Q07457 YER087C-AYER087C-A 552 nt2.63□□□□□ -1.99
BRE1Q07457 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt2.63□□□□□ -1.99
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