Protein–RNA interactions for Protein: Q06070

YLR407W, Uncharacterized protein YLR407W, yeastyeast

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR407WQ06070 DNL4YOR005C 2835 nt2.86□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 ASG1YIL130W 2895 nt2.86□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 INO80YGL150C 4470 nt2.85□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 SMC6YLR383W 3345 nt2.85□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 snR79snR79 84 nt2.85□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 YDL152WYDL152W 366 nt2.85□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.85□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 MSL1YIR009W 336 nt2.85□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 MAK21YDR060W 3078 nt2.84□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 YLR031WYLR031W 561 nt2.84□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 YDR413CYDR413C 576 nt2.83□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 ATP3YBR039W 936 nt2.83□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 ROX1YPR065W 1107 nt2.83□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 DYN1YKR054C 12279 nt2.83□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 KAP104YBR017C 2757 nt2.83□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 SEC7YDR170C 6030 nt2.83□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 CDC24YAL041W 2565 nt2.82□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 NEW1YPL226W 3591 nt2.82□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 NHP2YDL208W 471 nt2.82□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 UTP30YKR060W 825 nt2.82□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 EMC6YLL014W 327 nt2.82□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 RPL20AYMR242C 519 nt2.82□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 snR43snR43 209 nt2.82□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 PHO91YNR013C 2685 nt2.82□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 NAN1YPL126W 2691 nt2.82□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 PUF6YDR496C 1971 nt2.81□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 DUG2YBR281C 2637 nt2.81□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 MRD1YPR112C 2664 nt2.81□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 VPS41YDR080W 2979 nt2.81□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 MZM1YDR493W 372 nt2.81□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 YFR056CYFR056C 369 nt2.81□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 YNL010WYNL010W 726 nt2.81□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt2.81□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 PDR3YBL005W 2931 nt2.81□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 PRP8YHR165C 7242 nt2.8□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 KSP1YHR082C 3090 nt2.8□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 STE11YLR362W 2154 nt2.8□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 SGS1YMR190C 4344 nt2.8□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 SWT1YOR166C 1377 nt2.8□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 YDL011CYDL011C 324 nt2.8□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 YDR102CYDR102C 333 nt2.8□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 YER097WYER097W 330 nt2.8□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 YER121WYER121W 345 nt2.8□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 TWF1YGR080W 999 nt2.8□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 FCF2YLR051C 654 nt2.8□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 TIM18YOR297C 579 nt2.8□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 YPL182CYPL182C 384 nt2.8□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 RIF1YBR275C 5751 nt2.8□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 MSB1YOR188W 3414 nt2.8□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 MOT1YPL082C 5604 nt2.79□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 GCV2YMR189W 3105 nt2.79□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 YJL202CYJL202C 348 nt2.79□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 YPR089WYPR089W 2667 nt2.79□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 PCF11YDR228C 1881 nt2.79□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 KEL2YGR238C 2649 nt2.79□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 GIS4YML006C 2325 nt2.79□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.78□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 YMR324CYMR324C 243 nt2.78□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 FPR1YNL135C 345 nt2.78□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 IRC23YOR044W 474 nt2.78□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 YPR146CYPR146C 330 nt2.78□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 BUB1YGR188C 3066 nt2.78□□□□□ -1.96
YLR407WQ06070 REV1YOR346W 2958 nt2.77□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 SDC1YDR469W 528 nt2.77□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 YBL073WYBL073W 312 nt2.77□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 VPS13YLL040C 9435 nt2.77□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 SNQ2YDR011W 4506 nt2.76□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 MET6YER091C 2304 nt2.76□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 FIR1YER032W 2631 nt2.76□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 FKS3YMR306W 5358 nt2.76□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.76□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 PGA1YNL158W 597 nt2.76□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 PTC5YOR090C 1719 nt2.76□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 PRP6YBR055C 2700 nt2.75□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 snR65snR65 100 nt2.75□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 RPL26AYLR344W 384 nt2.75□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 ISF1YMR081C 1017 nt2.75□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 NCL1YBL024W 2055 nt2.75□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 IPT1YDR072C 1584 nt2.74□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 KAR3YPR141C 2190 nt2.74□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 YCR022CYCR022C 345 nt2.74□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.74□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 LSO2YGR169C-A 279 nt2.74□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 RPL39YJL189W 156 nt2.74□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 YKL083WYKL083W 615 nt2.74□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 CRS5YOR031W 210 nt2.74□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 SAK1YER129W 3429 nt2.74□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 RLI1YDR091C 1827 nt2.74□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 MPH1YIR002C 2982 nt2.74□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 UBP11YKR098C 2154 nt2.74□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 CYR1YJL005W 6081 nt2.73□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 SSN2YDR443C 4263 nt2.73□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 YPP1YGR198W 2454 nt2.73□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 snR70snR70 164 nt2.73□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 DAD4YDR320C-A 219 nt2.73□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 WIP1YDR374W-A 270 nt2.73□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 TMN3YER113C 2121 nt2.73□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 YFL032WYFL032W 321 nt2.73□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 LSM7YNL147W 348 nt2.73□□□□□ -1.97
YLR407WQ06070 snR36snR36 182 nt2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.4 ms