Protein–RNA interactions for Protein: P41808

SMK1, Sporulation-specific mitogen-activated protein kinase SMK1, yeastyeast

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMK1P41808 CDC24YAL041W 2565 nt2.48□□□□□ -2.01
SMK1P41808 YHR078WYHR078W 1659 nt2.47□□□□□ -2.01
SMK1P41808 VPS35YJL154C 2835 nt2.47□□□□□ -2.01
SMK1P41808 EDS1YBR033W 2760 nt2.47□□□□□ -2.01
SMK1P41808 CDC53YDL132W 2448 nt2.47□□□□□ -2.01
SMK1P41808 YPL150WYPL150W 2706 nt2.47□□□□□ -2.01
SMK1P41808 snR79snR79 84 nt2.47□□□□□ -2.01
SMK1P41808 YER121WYER121W 345 nt2.47□□□□□ -2.01
SMK1P41808 YIL174WYIL174W 228 nt2.47□□□□□ -2.01
SMK1P41808 RPS22AYJL190C 393 nt2.47□□□□□ -2.01
SMK1P41808 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.47□□□□□ -2.01
SMK1P41808 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.47□□□□□ -2.01
SMK1P41808 YAR047CYAR047C 321 nt2.47□□□□□ -2.01
SMK1P41808 YOR029WYOR029W 336 nt2.47□□□□□ -2.01
SMK1P41808 RTC6YPL183W-A 282 nt2.47□□□□□ -2.01
SMK1P41808 COX1Q0045 1605 nt2.46□□□□□ -2.02
SMK1P41808 AXL1YPR122W 3627 nt2.46□□□□□ -2.02
SMK1P41808 CDC50YCR094W 1176 nt2.46□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YER087C-AYER087C-A 552 nt2.46□□□□□ -2.02
SMK1P41808 SEC22YLR268W 645 nt2.46□□□□□ -2.02
SMK1P41808 RPS18BYML026C 441 nt2.46□□□□□ -2.02
SMK1P41808 AFI1YOR129C 2682 nt2.46□□□□□ -2.02
SMK1P41808 BCK1YJL095W 4437 nt2.46□□□□□ -2.02
SMK1P41808 ESL1YIL151C 3357 nt2.46□□□□□ -2.02
SMK1P41808 MSS11YMR164C 2277 nt2.45□□□□□ -2.02
SMK1P41808 CDC20YGL116W 1833 nt2.45□□□□□ -2.02
SMK1P41808 MET18YIL128W 3099 nt2.45□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YHR138CYHR138C 345 nt2.45□□□□□ -2.02
SMK1P41808 VTI1YMR197C 654 nt2.45□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YBL071CYBL071C 309 nt2.45□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt2.45□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YOL159CYOL159C 516 nt2.45□□□□□ -2.02
SMK1P41808 SGM1YJR134C 2124 nt2.45□□□□□ -2.02
SMK1P41808 VPS64YDR200C 1815 nt2.45□□□□□ -2.02
SMK1P41808 LSO2YGR169C-A 279 nt2.44□□□□□ -2.02
SMK1P41808 RPL14BYHL001W 417 nt2.44□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.44□□□□□ -2.02
SMK1P41808 SNC1YAL030W 354 nt2.44□□□□□ -2.02
SMK1P41808 UTP30YKR060W 825 nt2.44□□□□□ -2.02
SMK1P41808 EMC6YLL014W 327 nt2.44□□□□□ -2.02
SMK1P41808 PRE8YML092C 753 nt2.44□□□□□ -2.02
SMK1P41808 LCL1YPL056C 306 nt2.44□□□□□ -2.02
SMK1P41808 NUM1YDR150W 8247 nt2.44□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.43□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.43□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.43□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.43□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YER138CYER138C 5268 nt2.43□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YER160CYER160C 5268 nt2.43□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.43□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.43□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YJR027WYJR027W 5268 nt2.43□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.43□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YML039WYML039W 5268 nt2.43□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YML045WYML045W 5268 nt2.43□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YMR050CYMR050C 5268 nt2.43□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.43□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.43□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.43□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.43□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.43□□□□□ -2.02
SMK1P41808 KAR3YPR141C 2190 nt2.43□□□□□ -2.02
SMK1P41808 SOK2YMR016C 2358 nt2.43□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YRB1YDR002W 606 nt2.43□□□□□ -2.02
SMK1P41808 ATG31YDR022C 591 nt2.43□□□□□ -2.02
SMK1P41808 TMA22YJR014W 597 nt2.43□□□□□ -2.02
SMK1P41808 RPS17AYML024W 411 nt2.43□□□□□ -2.02
SMK1P41808 SNC2YOR327C 348 nt2.43□□□□□ -2.02
SMK1P41808 BNR1YIL159W 4128 nt2.43□□□□□ -2.02
SMK1P41808 MKT1YNL085W 2493 nt2.43□□□□□ -2.02
SMK1P41808 ESL2YKR096W 3588 nt2.43□□□□□ -2.02
SMK1P41808 SPO22YIL073C 2928 nt2.42□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.42□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.42□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YJR011CYJR011C 786 nt2.42□□□□□ -2.02
SMK1P41808 FCF2YLR051C 654 nt2.42□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YML003WYML003W 873 nt2.42□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YML084WYML084W 309 nt2.42□□□□□ -2.02
SMK1P41808 EGD1YPL037C 474 nt2.42□□□□□ -2.02
SMK1P41808 SRO77YBL106C 3033 nt2.42□□□□□ -2.02
SMK1P41808 CRM1YGR218W 3255 nt2.42□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YPR097WYPR097W 3222 nt2.42□□□□□ -2.02
SMK1P41808 SEC26YDR238C 2922 nt2.41□□□□□ -2.02
SMK1P41808 SWF1YDR126W 1011 nt2.41□□□□□ -2.02
SMK1P41808 SGD1YLR336C 2700 nt2.41□□□□□ -2.02
SMK1P41808 PSD2YGR170W 3417 nt2.41□□□□□ -2.02
SMK1P41808 RPO41YFL036W 4056 nt2.41□□□□□ -2.02
SMK1P41808 RTT10YPL183C 3042 nt2.4□□□□□ -2.02
SMK1P41808 YFH1YDL120W 525 nt2.4□□□□□ -2.03
SMK1P41808 YDR250CYDR250C 276 nt2.4□□□□□ -2.03
SMK1P41808 SDH7YDR511W 402 nt2.4□□□□□ -2.03
SMK1P41808 URM1YIL008W 300 nt2.4□□□□□ -2.03
SMK1P41808 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt2.4□□□□□ -2.03
SMK1P41808 GPX2YBR244W 489 nt2.4□□□□□ -2.03
SMK1P41808 ESC1YMR219W 4977 nt2.4□□□□□ -2.03
SMK1P41808 DIE2YGR227W 1578 nt2.4□□□□□ -2.03
SMK1P41808 UBR1YGR184C 5853 nt2.4□□□□□ -2.03
SMK1P41808 TIM9YEL020W-A 264 nt2.39□□□□□ -2.03
SMK1P41808 YKL066WYKL066W 444 nt2.39□□□□□ -2.03
SMK1P41808 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 94.6 ms