Protein–RNA interactions for Protein: P40557

EPS1, ER-retained PMA1-suppressing protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
EPS1P40557 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt4.98□□□□□ -1.61
EPS1P40557 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt4.98□□□□□ -1.61
EPS1P40557 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt4.98□□□□□ -1.61
EPS1P40557 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt4.98□□□□□ -1.61
EPS1P40557 HOS4YIL112W 3252 nt4.98□□□□□ -1.61
EPS1P40557 SKT5YBL061C 2091 nt4.97□□□□□ -1.61
EPS1P40557 PTC5YOR090C 1719 nt4.97□□□□□ -1.61
EPS1P40557 DOT6YER088C 2013 nt4.96□□□□□ -1.62
EPS1P40557 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt4.96□□□□□ -1.62
EPS1P40557 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt4.96□□□□□ -1.62
EPS1P40557 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt4.96□□□□□ -1.62
EPS1P40557 PSE1YMR308C 3270 nt4.96□□□□□ -1.62
EPS1P40557 SLX4YLR135W 2247 nt4.96□□□□□ -1.62
EPS1P40557 VPS53YJL029C 2469 nt4.96□□□□□ -1.62
EPS1P40557 TIM11YDR322C-A 291 nt4.95□□□□□ -1.62
EPS1P40557 YOR019WYOR019W 2193 nt4.95□□□□□ -1.62
EPS1P40557 PEP5YMR231W 3090 nt4.95□□□□□ -1.62
EPS1P40557 SMY1YKL079W 1971 nt4.95□□□□□ -1.62
EPS1P40557 YGR050CYGR050C 357 nt4.94□□□□□ -1.62
EPS1P40557 ZIP2YGL249W 2115 nt4.94□□□□□ -1.62
EPS1P40557 MSK1YNL073W 1731 nt4.94□□□□□ -1.62
EPS1P40557 MUS81YDR386W 1899 nt4.94□□□□□ -1.62
EPS1P40557 FRE2YKL220C 2136 nt4.93□□□□□ -1.62
EPS1P40557 MCD4YKL165C 2760 nt4.93□□□□□ -1.62
EPS1P40557 RDN5-1RDN5-1 121 nt4.93□□□□□ -1.62
EPS1P40557 RDN5-6RDN5-6 121 nt4.93□□□□□ -1.62
EPS1P40557 EFR3YMR212C 2349 nt4.93□□□□□ -1.62
EPS1P40557 CTF4YPR135W 2784 nt4.93□□□□□ -1.62
EPS1P40557 KAR3YPR141C 2190 nt4.93□□□□□ -1.62
EPS1P40557 MPT5YGL178W 2580 nt4.92□□□□□ -1.62
EPS1P40557 GPI13YLL031C 3054 nt4.92□□□□□ -1.62
EPS1P40557 COS111YBR203W 2775 nt4.92□□□□□ -1.62
EPS1P40557 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt4.92□□□□□ -1.62
EPS1P40557 INP2YMR163C 2118 nt4.92□□□□□ -1.62
EPS1P40557 RPL25YOL127W 429 nt4.92□□□□□ -1.62
EPS1P40557 CDC31YOR257W 486 nt4.92□□□□□ -1.62
EPS1P40557 KIN2YLR096W 3444 nt4.92□□□□□ -1.62
EPS1P40557 NPR1YNL183C 2373 nt4.92□□□□□ -1.62
EPS1P40557 SEC39YLR440C 2130 nt4.91□□□□□ -1.62
EPS1P40557 NOC3YLR002C 1992 nt4.91□□□□□ -1.62
EPS1P40557 ASK10YGR097W 3441 nt4.91□□□□□ -1.62
EPS1P40557 YPL044CYPL044C 549 nt4.91□□□□□ -1.62
EPS1P40557 ADP1YCR011C 3150 nt4.91□□□□□ -1.62
EPS1P40557 KAP114YGL241W 3015 nt4.91□□□□□ -1.62
EPS1P40557 SIP3YNL257C 3690 nt4.9□□□□□ -1.62
EPS1P40557 YDL176WYDL176W 2127 nt4.9□□□□□ -1.62
EPS1P40557 PAN1YIR006C 4443 nt4.9□□□□□ -1.62
EPS1P40557 LSO2YGR169C-A 279 nt4.9□□□□□ -1.63
EPS1P40557 NUP85YJR042W 2235 nt4.9□□□□□ -1.63
EPS1P40557 TGL4YKR089C 2733 nt4.9□□□□□ -1.63
EPS1P40557 FZO1YBR179C 2568 nt4.89□□□□□ -1.63
EPS1P40557 YDL196WYDL196W 330 nt4.89□□□□□ -1.63
EPS1P40557 HYP2YEL034W 474 nt4.89□□□□□ -1.63
EPS1P40557 GIN4YDR507C 3429 nt4.88□□□□□ -1.63
EPS1P40557 SPC105YGL093W 2754 nt4.88□□□□□ -1.63
EPS1P40557 RPG1YBR079C 2895 nt4.88□□□□□ -1.63
EPS1P40557 YDR193WYDR193W 399 nt4.88□□□□□ -1.63
EPS1P40557 MDV1YJL112W 2145 nt4.88□□□□□ -1.63
EPS1P40557 PHD1YKL043W 1101 nt4.87□□□□□ -1.63
EPS1P40557 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt4.86□□□□□ -1.63
EPS1P40557 RPS17BYDR447C 411 nt4.86□□□□□ -1.63
EPS1P40557 YGR125WYGR125W 3111 nt4.86□□□□□ -1.63
EPS1P40557 ZIP1YDR285W 2628 nt4.86□□□□□ -1.63
EPS1P40557 GPR1YDL035C 2886 nt4.86□□□□□ -1.63
EPS1P40557 DUF1YOL087C 3351 nt4.85□□□□□ -1.63
EPS1P40557 snR81snR81 201 nt4.85□□□□□ -1.63
EPS1P40557 SMT3YDR510W 306 nt4.85□□□□□ -1.63
EPS1P40557 YNR065CYNR065C 3351 nt4.85□□□□□ -1.63
EPS1P40557 RPL31AYDL075W 342 nt4.84□□□□□ -1.63
EPS1P40557 YER039C-AYER039C-A 219 nt4.84□□□□□ -1.63
EPS1P40557 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt4.84□□□□□ -1.64
EPS1P40557 APL5YPL195W 2799 nt4.83□□□□□ -1.64
EPS1P40557 YML116W-AYML116W-A 303 nt4.83□□□□□ -1.64
EPS1P40557 SLY1YDR189W 2001 nt4.83□□□□□ -1.64
EPS1P40557 MSD1YPL104W 1977 nt4.83□□□□□ -1.64
EPS1P40557 FIG4YNL325C 2640 nt4.82□□□□□ -1.64
EPS1P40557 YNL266WYNL266W 420 nt4.82□□□□□ -1.64
EPS1P40557 MSH2YOL090W 2895 nt4.82□□□□□ -1.64
EPS1P40557 VPH1YOR270C 2523 nt4.81□□□□□ -1.64
EPS1P40557 VMA9YCL005W-A 222 nt4.81□□□□□ -1.64
EPS1P40557 ABP140YOR239W 1887 nt4.81□□□□□ -1.64
EPS1P40557 YKL050CYKL050C 2769 nt4.81□□□□□ -1.64
EPS1P40557 PCA1YBR295W 3651 nt4.81□□□□□ -1.64
EPS1P40557 PUF4YGL014W 2667 nt4.8□□□□□ -1.64
EPS1P40557 PEP3YLR148W 2757 nt4.8□□□□□ -1.64
EPS1P40557 TAF6YGL112C 1551 nt4.8□□□□□ -1.64
EPS1P40557 GIS4YML006C 2325 nt4.79□□□□□ -1.64
EPS1P40557 LYS2YBR115C 4179 nt4.79□□□□□ -1.64
EPS1P40557 VHS3YOR054C 2025 nt4.79□□□□□ -1.64
EPS1P40557 LOS1YKL205W 3303 nt4.79□□□□□ -1.64
EPS1P40557 YDR089WYDR089W 2610 nt4.79□□□□□ -1.64
EPS1P40557 BRE4YDL231C 3378 nt4.78□□□□□ -1.64
EPS1P40557 IOC2YLR095C 2439 nt4.78□□□□□ -1.64
EPS1P40557 AI2Q0055 2565 nt4.78□□□□□ -1.64
EPS1P40557 NUP120YKL057C 3114 nt4.78□□□□□ -1.64
EPS1P40557 ZDS1YMR273C 2748 nt4.78□□□□□ -1.64
EPS1P40557 SEC63YOR254C 1992 nt4.77□□□□□ -1.65
EPS1P40557 VHC1YBR235W 3363 nt4.76□□□□□ -1.65
EPS1P40557 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt4.76□□□□□ -1.65
EPS1P40557 BCH1YMR237W 2175 nt4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.8 ms