Protein–RNA interactions for Protein: P40550

PDR11, ATP-dependent permease PDR11, yeastyeast

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR11P40550 NSE4YDL105W 1209 nt0.76□□□□□ -2.29
PDR11P40550 YMR099CYMR099C 894 nt0.76□□□□□ -2.29
PDR11P40550 SRB4YER022W 2064 nt0.75□□□□□ -2.29
PDR11P40550 AI3Q0060 1248 nt0.75□□□□□ -2.29
PDR11P40550 YHR022CYHR022C 771 nt0.75□□□□□ -2.29
PDR11P40550 FYV4YHR059W 393 nt0.75□□□□□ -2.29
PDR11P40550 YHR212CYHR212C 336 nt0.75□□□□□ -2.29
PDR11P40550 RPL40AYIL148W 387 nt0.75□□□□□ -2.29
PDR11P40550 YAR060CYAR060C 336 nt0.75□□□□□ -2.29
PDR11P40550 UBX4YMR067C 1251 nt0.75□□□□□ -2.29
PDR11P40550 ADF1YCL058W-A 342 nt0.75□□□□□ -2.29
PDR11P40550 YDR338CYDR338C 2088 nt0.75□□□□□ -2.29
PDR11P40550 SLK19YOR195W 2466 nt0.75□□□□□ -2.29
PDR11P40550 AZF1YOR113W 2745 nt0.75□□□□□ -2.29
PDR11P40550 MUK1YPL070W 1839 nt0.74□□□□□ -2.29
PDR11P40550 YDR286CYDR286C 345 nt0.73□□□□□ -2.29
PDR11P40550 MRPL40YPL173W 894 nt0.73□□□□□ -2.29
PDR11P40550 PSO2YMR137C 1986 nt0.73□□□□□ -2.29
PDR11P40550 ASI3YNL008C 2031 nt0.73□□□□□ -2.29
PDR11P40550 BFR1YOR198C 1413 nt0.73□□□□□ -2.29
PDR11P40550 YFR054CYFR054C 579 nt0.72□□□□□ -2.29
PDR11P40550 YJR029WYJR029W 5268 nt0.72□□□□□ -2.29
PDR11P40550 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.72□□□□□ -2.29
PDR11P40550 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt0.72□□□□□ -2.29
PDR11P40550 FIP1YJR093C 984 nt0.72□□□□□ -2.29
PDR11P40550 PRP39YML046W 1890 nt0.71□□□□□ -2.3
PDR11P40550 YGR290WYGR290W 444 nt0.71□□□□□ -2.3
PDR11P40550 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt0.71□□□□□ -2.3
PDR11P40550 SRP21YKL122C 504 nt0.71□□□□□ -2.3
PDR11P40550 CMC2YBL059C-A 330 nt0.71□□□□□ -2.3
PDR11P40550 CUR1YPR158W 759 nt0.71□□□□□ -2.3
PDR11P40550 MVP1YMR004W 1536 nt0.7□□□□□ -2.3
PDR11P40550 MDM36YPR083W 1740 nt0.7□□□□□ -2.3
PDR11P40550 MFA1YDR461W 111 nt0.7□□□□□ -2.3
PDR11P40550 ZRG8YER033C 3231 nt0.69□□□□□ -2.3
PDR11P40550 SNC2YOR327C 348 nt0.69□□□□□ -2.3
PDR11P40550 NOP12YOL041C 1380 nt0.69□□□□□ -2.3
PDR11P40550 DGR2YKL121W 2559 nt0.69□□□□□ -2.3
PDR11P40550 SPC1YJR010C-A 285 nt0.68□□□□□ -2.3
PDR11P40550 ALY2YJL084C 3141 nt0.68□□□□□ -2.3
PDR11P40550 RGI1YER067W 486 nt0.67□□□□□ -2.3
PDR11P40550 COF1YLL050C 432 nt0.67□□□□□ -2.3
PDR11P40550 SAS3YBL052C 2496 nt0.67□□□□□ -2.3
PDR11P40550 AHC2YCR082W 387 nt0.66□□□□□ -2.3
PDR11P40550 UBC9YDL064W 474 nt0.66□□□□□ -2.3
PDR11P40550 FAR7YFR008W 666 nt0.66□□□□□ -2.3
PDR11P40550 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.66□□□□□ -2.3
PDR11P40550 RPB5YBR154C 648 nt0.66□□□□□ -2.3
PDR11P40550 CDC5YMR001C 2118 nt0.65□□□□□ -2.3
PDR11P40550 YAL069WYAL069W 315 nt0.65□□□□□ -2.3
PDR11P40550 PEX15YOL044W 1152 nt0.65□□□□□ -2.3
PDR11P40550 SFM1YOR021C 642 nt0.64□□□□□ -2.31
PDR11P40550 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.64□□□□□ -2.31
PDR11P40550 YGL039WYGL039W 1047 nt0.64□□□□□ -2.31
PDR11P40550 CIN2YPL241C 807 nt0.64□□□□□ -2.31
PDR11P40550 YGR219WYGR219W 342 nt0.63□□□□□ -2.31
PDR11P40550 YBL094CYBL094C 333 nt0.63□□□□□ -2.31
PDR11P40550 FUS2YMR232W 2034 nt0.63□□□□□ -2.31
PDR11P40550 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.62□□□□□ -2.31
PDR11P40550 YGR250CYGR250C 2346 nt0.61□□□□□ -2.31
PDR11P40550 YGL177WYGL177W 348 nt0.61□□□□□ -2.31
PDR11P40550 SVP26YHR181W 687 nt0.61□□□□□ -2.31
PDR11P40550 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.61□□□□□ -2.31
PDR11P40550 YNL089CYNL089C 477 nt0.61□□□□□ -2.31
PDR11P40550 SMY1YKL079W 1971 nt0.61□□□□□ -2.31
PDR11P40550 MEI4YER044C-A 1227 nt0.6□□□□□ -2.31
PDR11P40550 NOP10YHR072W-A 177 nt0.6□□□□□ -2.31
PDR11P40550 YIL089WYIL089W 618 nt0.6□□□□□ -2.31
PDR11P40550 YMR147WYMR147W 672 nt0.6□□□□□ -2.31
PDR11P40550 YNL179CYNL179C 438 nt0.6□□□□□ -2.31
PDR11P40550 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.6□□□□□ -2.31
PDR11P40550 NUP188YML103C 4968 nt0.6□□□□□ -2.31
PDR11P40550 YER088C-AYER088C-A 324 nt0.59□□□□□ -2.31
PDR11P40550 YAP3YHL009C 993 nt0.59□□□□□ -2.31
PDR11P40550 RPI1YIL119C 1224 nt0.59□□□□□ -2.31
PDR11P40550 YIL141WYIL141W 390 nt0.59□□□□□ -2.31
PDR11P40550 IRC19YLL033W 693 nt0.59□□□□□ -2.31
PDR11P40550 ARL3YPL051W 597 nt0.59□□□□□ -2.31
PDR11P40550 YLL054CYLL054C 2532 nt0.58□□□□□ -2.32
PDR11P40550 YNL226WYNL226W 411 nt0.58□□□□□ -2.32
PDR11P40550 MIX23YBL107C 591 nt0.58□□□□□ -2.32
PDR11P40550 YML002WYML002W 2214 nt0.58□□□□□ -2.32
PDR11P40550 RPL35BYDL136W 363 nt0.57□□□□□ -2.32
PDR11P40550 DAS1YJL149W 1992 nt0.57□□□□□ -2.32
PDR11P40550 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt0.56□□□□□ -2.32
PDR11P40550 YDL157CYDL157C 357 nt0.56□□□□□ -2.32
PDR11P40550 NSE3YDR288W 912 nt0.56□□□□□ -2.32
PDR11P40550 MRPL24YMR193W 777 nt0.56□□□□□ -2.32
PDR11P40550 YNL010WYNL010W 726 nt0.56□□□□□ -2.32
PDR11P40550 ESA1YOR244W 1338 nt0.56□□□□□ -2.32
PDR11P40550 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt0.55□□□□□ -2.32
PDR11P40550 BTN2YGR142W 1233 nt0.55□□□□□ -2.32
PDR11P40550 HYR1YIR037W 492 nt0.55□□□□□ -2.32
PDR11P40550 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.55□□□□□ -2.32
PDR11P40550 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt0.55□□□□□ -2.32
PDR11P40550 BFA1YJR053W 1725 nt0.55□□□□□ -2.32
PDR11P40550 RIF2YLR453C 1188 nt0.55□□□□□ -2.32
PDR11P40550 YNR068CYNR068C 819 nt0.55□□□□□ -2.32
PDR11P40550 MSC6YOR354C 2079 nt0.54□□□□□ -2.32
PDR11P40550 RRT16YNL105W 429 nt0.54□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 71.8 ms