Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 NUP82YJL061W 2142 nt2□□□□□ -2.09
SEC28P40509 VPS35YJL154C 2835 nt2□□□□□ -2.09
SEC28P40509 RIC1YLR039C 3171 nt2□□□□□ -2.09
SEC28P40509 YMR045CYMR045C 5268 nt2□□□□□ -2.09
SEC28P40509 HCS1YKL017C 2052 nt2□□□□□ -2.09
SEC28P40509 SPO13YHR014W 876 nt2□□□□□ -2.09
SEC28P40509 RPA34YJL148W 702 nt2□□□□□ -2.09
SEC28P40509 YDL062WYDL062W 426 nt1.99□□□□□ -2.09
SEC28P40509 YDR042CYDR042C 603 nt1.99□□□□□ -2.09
SEC28P40509 OCA6YDR067C 675 nt1.99□□□□□ -2.09
SEC28P40509 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt1.99□□□□□ -2.09
SEC28P40509 BUD19YJL188C 309 nt1.99□□□□□ -2.09
SEC28P40509 YLR271WYLR271W 825 nt1.99□□□□□ -2.09
SEC28P40509 SNC2YOR327C 348 nt1.99□□□□□ -2.09
SEC28P40509 SCH9YHR205W 2475 nt1.99□□□□□ -2.09
SEC28P40509 CDC27YBL084C 2277 nt1.98□□□□□ -2.09
SEC28P40509 UBR2YLR024C 5619 nt1.98□□□□□ -2.09
SEC28P40509 RPH1YER169W 2391 nt1.98□□□□□ -2.09
SEC28P40509 YIL029CYIL029C 429 nt1.98□□□□□ -2.09
SEC28P40509 AFB1YLR040C 675 nt1.98□□□□□ -2.09
SEC28P40509 SWS2YNL081C 432 nt1.98□□□□□ -2.09
SEC28P40509 YPL197CYPL197C 414 nt1.98□□□□□ -2.09
SEC28P40509 NUP120YKL057C 3114 nt1.98□□□□□ -2.09
SEC28P40509 UTP13YLR222C 2454 nt1.98□□□□□ -2.09
SEC28P40509 STB4YMR019W 2850 nt1.97□□□□□ -2.09
SEC28P40509 EMP24YGL200C 612 nt1.97□□□□□ -2.09
SEC28P40509 SPC1YJR010C-A 285 nt1.97□□□□□ -2.09
SEC28P40509 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt1.97□□□□□ -2.09
SEC28P40509 GMC2YLR445W 567 nt1.97□□□□□ -2.09
SEC28P40509 CHC1YGL206C 4962 nt1.96□□□□□ -2.1
SEC28P40509 NCE101YJL205C 162 nt1.96□□□□□ -2.1
SEC28P40509 SIP18YMR175W 240 nt1.96□□□□□ -2.1
SEC28P40509 YBL108WYBL108W 306 nt1.96□□□□□ -2.1
SEC28P40509 AGC1YPR021C 2709 nt1.95□□□□□ -2.1
SEC28P40509 COX13YGL191W 390 nt1.95□□□□□ -2.1
SEC28P40509 CYB5YNL111C 363 nt1.95□□□□□ -2.1
SEC28P40509 RTC6YPL183W-A 282 nt1.95□□□□□ -2.1
SEC28P40509 YJL016WYJL016W 1686 nt1.95□□□□□ -2.1
SEC28P40509 RTR2YDR066C 591 nt1.94□□□□□ -2.1
SEC28P40509 BTT1YDR252W 450 nt1.94□□□□□ -2.1
SEC28P40509 YGL069CYGL069C 465 nt1.94□□□□□ -2.1
SEC28P40509 HSK3YKL138C-A 210 nt1.94□□□□□ -2.1
SEC28P40509 YPL238CYPL238C 390 nt1.94□□□□□ -2.1
SEC28P40509 VMR1YHL035C 4779 nt1.94□□□□□ -2.1
SEC28P40509 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt1.93□□□□□ -2.1
SEC28P40509 ARP7YPR034W 1434 nt1.93□□□□□ -2.1
SEC28P40509 HNT1YDL125C 477 nt1.93□□□□□ -2.1
SEC28P40509 YDR220CYDR220C 294 nt1.93□□□□□ -2.1
SEC28P40509 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt1.93□□□□□ -2.1
SEC28P40509 SEC22YLR268W 645 nt1.93□□□□□ -2.1
SEC28P40509 TMA10YLR327C 261 nt1.93□□□□□ -2.1
SEC28P40509 RBL2YOR265W 321 nt1.93□□□□□ -2.1
SEC28P40509 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.93□□□□□ -2.1
SEC28P40509 GPX2YBR244W 489 nt1.93□□□□□ -2.1
SEC28P40509 GCN2YDR283C 4980 nt1.93□□□□□ -2.1
SEC28P40509 MUD2YKL074C 1584 nt1.93□□□□□ -2.1
SEC28P40509 SET2YJL168C 2202 nt1.93□□□□□ -2.1
SEC28P40509 PLC1YPL268W 2610 nt1.92□□□□□ -2.1
SEC28P40509 YMR324CYMR324C 243 nt1.92□□□□□ -2.1
SEC28P40509 DFG16YOR030W 1860 nt1.92□□□□□ -2.1
SEC28P40509 PGA1YNL158W 597 nt1.91□□□□□ -2.1
SEC28P40509 TDA9YML081W 3756 nt1.9□□□□□ -2.1
SEC28P40509 HSH155YMR288W 2916 nt1.9□□□□□ -2.1
SEC28P40509 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.9□□□□□ -2.11
SEC28P40509 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt1.9□□□□□ -2.11
SEC28P40509 YKL111CYKL111C 336 nt1.9□□□□□ -2.11
SEC28P40509 BER1YLR412W 825 nt1.9□□□□□ -2.11
SEC28P40509 SEN15YMR059W 387 nt1.9□□□□□ -2.11
SEC28P40509 SPC29YPL124W 762 nt1.9□□□□□ -2.11
SEC28P40509 MYO2YOR326W 4725 nt1.9□□□□□ -2.11
SEC28P40509 RNH70YGR276C 1662 nt1.9□□□□□ -2.11
SEC28P40509 PEP1YBL017C 4740 nt1.89□□□□□ -2.11
SEC28P40509 DAD4YDR320C-A 219 nt1.89□□□□□ -2.11
SEC28P40509 VPS34YLR240W 2628 nt1.89□□□□□ -2.11
SEC28P40509 LRE1YCL051W 1752 nt1.89□□□□□ -2.11
SEC28P40509 YJR039WYJR039W 3366 nt1.89□□□□□ -2.11
SEC28P40509 YLR149CYLR149C 2193 nt1.89□□□□□ -2.11
SEC28P40509 MYO4YAL029C 4416 nt1.89□□□□□ -2.11
SEC28P40509 MNL2YLR057W 2550 nt1.89□□□□□ -2.11
SEC28P40509 SGD1YLR336C 2700 nt1.89□□□□□ -2.11
SEC28P40509 YNL144CYNL144C 2223 nt1.89□□□□□ -2.11
SEC28P40509 SEC63YOR254C 1992 nt1.89□□□□□ -2.11
SEC28P40509 SAC3YDR159W 3906 nt1.88□□□□□ -2.11
SEC28P40509 IRC10YOL015W 1761 nt1.88□□□□□ -2.11
SEC28P40509 YDL158CYDL158C 309 nt1.88□□□□□ -2.11
SEC28P40509 IES5YER092W 378 nt1.88□□□□□ -2.11
SEC28P40509 GIC1YHR061C 945 nt1.88□□□□□ -2.11
SEC28P40509 YOR093CYOR093C 4947 nt1.88□□□□□ -2.11
SEC28P40509 SPR3YGR059W 1539 nt1.87□□□□□ -2.11
SEC28P40509 NOT5YPR072W 1683 nt1.87□□□□□ -2.11
SEC28P40509 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.87□□□□□ -2.11
SEC28P40509 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt1.87□□□□□ -2.11
SEC28P40509 LSO2YGR169C-A 279 nt1.87□□□□□ -2.11
SEC28P40509 LHS1YKL073W 2646 nt1.87□□□□□ -2.11
SEC28P40509 IRC19YLL033W 693 nt1.87□□□□□ -2.11
SEC28P40509 REV3YPL167C 4515 nt1.87□□□□□ -2.11
SEC28P40509 VPS52YDR484W 1926 nt1.87□□□□□ -2.11
SEC28P40509 DIS3YOL021C 3006 nt1.87□□□□□ -2.11
SEC28P40509 SSQ1YLR369W 1974 nt1.87□□□□□ -2.11
SEC28P40509 KAR3YPR141C 2190 nt1.86□□□□□ -2.11
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