Protein–RNA interactions for Protein: P27692

SPT5, Transcription elongation factor SPT5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT5P27692 RDS1YCR106W 2499 nt3.93□□□□□ -1.78
SPT5P27692 KAP95YLR347C 2586 nt3.92□□□□□ -1.78
SPT5P27692 FAR1YJL157C 2493 nt3.92□□□□□ -1.78
SPT5P27692 TIM11YDR322C-A 291 nt3.92□□□□□ -1.78
SPT5P27692 YFL065CYFL065C 309 nt3.92□□□□□ -1.78
SPT5P27692 RPL38YLR325C 237 nt3.92□□□□□ -1.78
SPT5P27692 GIN4YDR507C 3429 nt3.92□□□□□ -1.78
SPT5P27692 BOI1YBL085W 2943 nt3.92□□□□□ -1.78
SPT5P27692 MSR1YHR091C 1932 nt3.91□□□□□ -1.78
SPT5P27692 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt3.91□□□□□ -1.78
SPT5P27692 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt3.91□□□□□ -1.78
SPT5P27692 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt3.91□□□□□ -1.78
SPT5P27692 YGL069CYGL069C 465 nt3.91□□□□□ -1.78
SPT5P27692 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt3.91□□□□□ -1.78
SPT5P27692 PCC1YKR095W-A 267 nt3.91□□□□□ -1.78
SPT5P27692 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt3.91□□□□□ -1.78
SPT5P27692 CSE2YNR010W 450 nt3.91□□□□□ -1.78
SPT5P27692 YOR015WYOR015W 360 nt3.91□□□□□ -1.78
SPT5P27692 snR48snR48 113 nt3.91□□□□□ -1.78
SPT5P27692 YCL019WYCL019W 5313 nt3.91□□□□□ -1.78
SPT5P27692 RAD4YER162C 2265 nt3.91□□□□□ -1.78
SPT5P27692 HDA3YPR179C 1968 nt3.91□□□□□ -1.78
SPT5P27692 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt3.9□□□□□ -1.78
SPT5P27692 SPA2YLL021W 4401 nt3.9□□□□□ -1.78
SPT5P27692 YGR164WYGR164W 336 nt3.9□□□□□ -1.79
SPT5P27692 TMA19YKL056C 504 nt3.9□□□□□ -1.79
SPT5P27692 UPS1YLR193C 528 nt3.9□□□□□ -1.79
SPT5P27692 SPB1YCL054W 2526 nt3.9□□□□□ -1.79
SPT5P27692 NUP120YKL057C 3114 nt3.9□□□□□ -1.79
SPT5P27692 DIA2YOR080W 2199 nt3.89□□□□□ -1.79
SPT5P27692 BMS1YPL217C 3552 nt3.88□□□□□ -1.79
SPT5P27692 YJL070CYJL070C 2667 nt3.88□□□□□ -1.79
SPT5P27692 SSM4YIL030C 3960 nt3.87□□□□□ -1.79
SPT5P27692 YML007C-AYML007C-A 111 nt3.87□□□□□ -1.79
SPT5P27692 GOT1YMR292W 417 nt3.87□□□□□ -1.79
SPT5P27692 DFG16YOR030W 1860 nt3.87□□□□□ -1.79
SPT5P27692 VPS53YJL029C 2469 nt3.87□□□□□ -1.79
SPT5P27692 NTO1YPR031W 2247 nt3.87□□□□□ -1.79
SPT5P27692 IPT1YDR072C 1584 nt3.86□□□□□ -1.79
SPT5P27692 YER189WYER189W 369 nt3.86□□□□□ -1.79
SPT5P27692 YBL083CYBL083C 426 nt3.86□□□□□ -1.79
SPT5P27692 DOT6YER088C 2013 nt3.86□□□□□ -1.79
SPT5P27692 NPR3YHL023C 3441 nt3.86□□□□□ -1.79
SPT5P27692 SNU114YKL173W 3027 nt3.85□□□□□ -1.79
SPT5P27692 LCD1YDR499W 2244 nt3.85□□□□□ -1.79
SPT5P27692 RRT15YLR162W-A 189 nt3.85□□□□□ -1.79
SPT5P27692 STT4YLR305C 5703 nt3.85□□□□□ -1.79
SPT5P27692 SYT1YPR095C 3681 nt3.85□□□□□ -1.79
SPT5P27692 PHO2YDL106C 1680 nt3.84□□□□□ -1.79
SPT5P27692 DAN4YJR151C 3486 nt3.84□□□□□ -1.79
SPT5P27692 ZDS2YML109W 2829 nt3.84□□□□□ -1.79
SPT5P27692 ITC1YGL133W 3795 nt3.84□□□□□ -1.79
SPT5P27692 MRP10YDL045W-A 288 nt3.84□□□□□ -1.79
SPT5P27692 YDR426CYDR426C 378 nt3.84□□□□□ -1.79
SPT5P27692 RTC6YPL183W-A 282 nt3.84□□□□□ -1.79
SPT5P27692 DUF1YOL087C 3351 nt3.84□□□□□ -1.79
SPT5P27692 RLI1YDR091C 1827 nt3.84□□□□□ -1.8
SPT5P27692 NOP4YPL043W 2058 nt3.83□□□□□ -1.8
SPT5P27692 MDV1YJL112W 2145 nt3.83□□□□□ -1.8
SPT5P27692 PRE4YFR050C 801 nt3.83□□□□□ -1.8
SPT5P27692 ANB1YJR047C 474 nt3.83□□□□□ -1.8
SPT5P27692 COF1YLL050C 432 nt3.83□□□□□ -1.8
SPT5P27692 LRG1YDL240W 3054 nt3.83□□□□□ -1.8
SPT5P27692 FLO9YAL063C 3969 nt3.83□□□□□ -1.8
SPT5P27692 POM152YMR129W 4014 nt3.82□□□□□ -1.8
SPT5P27692 YLR255CYLR255C 354 nt3.82□□□□□ -1.8
SPT5P27692 NUT2YPR168W 474 nt3.82□□□□□ -1.8
SPT5P27692 SOK1YDR006C 2706 nt3.82□□□□□ -1.8
SPT5P27692 SQS1YNL224C 2304 nt3.82□□□□□ -1.8
SPT5P27692 PUF4YGL014W 2667 nt3.81□□□□□ -1.8
SPT5P27692 MTC3YGL226W 372 nt3.81□□□□□ -1.8
SPT5P27692 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.81□□□□□ -1.8
SPT5P27692 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.81□□□□□ -1.8
SPT5P27692 PSK2YOL045W 3306 nt3.81□□□□□ -1.8
SPT5P27692 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt3.81□□□□□ -1.8
SPT5P27692 GUP1YGL084C 1683 nt3.81□□□□□ -1.8
SPT5P27692 PAN3YKL025C 2040 nt3.8□□□□□ -1.8
SPT5P27692 YPR022CYPR022C 3402 nt3.8□□□□□ -1.8
SPT5P27692 FPR1YNL135C 345 nt3.8□□□□□ -1.8
SPT5P27692 YBR224WYBR224W 516 nt3.8□□□□□ -1.8
SPT5P27692 TAF1YGR274C 3201 nt3.8□□□□□ -1.8
SPT5P27692 SIZ1YDR409W 2715 nt3.8□□□□□ -1.8
SPT5P27692 PDE2YOR360C 1581 nt3.8□□□□□ -1.8
SPT5P27692 RAD5YLR032W 3510 nt3.79□□□□□ -1.8
SPT5P27692 SAK1YER129W 3429 nt3.79□□□□□ -1.8
SPT5P27692 SMC3YJL074C 3693 nt3.79□□□□□ -1.8
SPT5P27692 YOL057WYOL057W 2136 nt3.79□□□□□ -1.8
SPT5P27692 MET5YJR137C 4329 nt3.79□□□□□ -1.8
SPT5P27692 YAT2YER024W 2772 nt3.79□□□□□ -1.8
SPT5P27692 ALK2YBL009W 2031 nt3.79□□□□□ -1.8
SPT5P27692 SSS1YDR086C 243 nt3.79□□□□□ -1.8
SPT5P27692 ERP6YGL002W 651 nt3.79□□□□□ -1.8
SPT5P27692 INA22YIR024C 651 nt3.79□□□□□ -1.8
SPT5P27692 LSM7YNL147W 348 nt3.79□□□□□ -1.8
SPT5P27692 SLA1YBL007C 3735 nt3.79□□□□□ -1.8
SPT5P27692 RPA190YOR341W 4995 nt3.78□□□□□ -1.8
SPT5P27692 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt3.78□□□□□ -1.8
SPT5P27692 MPH1YIR002C 2982 nt3.78□□□□□ -1.8
SPT5P27692 TRX1YLR043C 312 nt3.78□□□□□ -1.8
SPT5P27692 SET1YHR119W 3243 nt3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.2 ms