Protein–RNA interactions for Protein: P0CX20

YRF1-1, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 1, yeastyeast

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Length 1,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-1P0CX20 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt0.68□□□□□ -2.3
YRF1-1P0CX20 KAP122YGL016W 3246 nt0.67□□□□□ -2.3
YRF1-1P0CX20 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt0.67□□□□□ -2.3
YRF1-1P0CX20 CUP9YPL177C 921 nt0.67□□□□□ -2.3
YRF1-1P0CX20 MTC7YEL033W 420 nt0.66□□□□□ -2.3
YRF1-1P0CX20 PET123YOR158W 957 nt0.66□□□□□ -2.3
YRF1-1P0CX20 CSE1YGL238W 2883 nt0.66□□□□□ -2.3
YRF1-1P0CX20 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.66□□□□□ -2.3
YRF1-1P0CX20 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt0.65□□□□□ -2.3
YRF1-1P0CX20 YFR056CYFR056C 369 nt0.65□□□□□ -2.3
YRF1-1P0CX20 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt0.65□□□□□ -2.3
YRF1-1P0CX20 YIL012WYIL012W 342 nt0.65□□□□□ -2.3
YRF1-1P0CX20 YAR068WYAR068W 486 nt0.65□□□□□ -2.3
YRF1-1P0CX20 CTK3YML112W 891 nt0.65□□□□□ -2.3
YRF1-1P0CX20 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.65□□□□□ -2.3
YRF1-1P0CX20 NSL1YPL233W 651 nt0.65□□□□□ -2.3
YRF1-1P0CX20 snR35snR35 204 nt0.65□□□□□ -2.3
YRF1-1P0CX20 SPC1YJR010C-A 285 nt0.65□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 DYN3YMR299C 939 nt0.65□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 RLM1YPL089C 2031 nt0.64□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 CMC2YBL059C-A 330 nt0.64□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 YPR063CYPR063C 423 nt0.64□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 CDC5YMR001C 2118 nt0.64□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 ESA1YOR244W 1338 nt0.64□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 YCR015CYCR015C 954 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 YJL022WYJL022W 309 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 VPS55YJR044C 423 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 YBR063CYBR063C 1215 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 TCA17YEL048C 459 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 FYV4YHR059W 393 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 MER1YNL210W 813 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 YBR032WYBR032W 303 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 YLL054CYLL054C 2532 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 NSE4YDL105W 1209 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 AI3Q0060 1248 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 IES5YER092W 378 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.61□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 CSI2YOL007C 1026 nt0.61□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 SNC2YOR327C 348 nt0.61□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 NSE3YDR288W 912 nt0.6□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 YGL039WYGL039W 1047 nt0.6□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 YNR068CYNR068C 819 nt0.6□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 PEP3YLR148W 2757 nt0.6□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 RIF2YLR453C 1188 nt0.6□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 COX1Q0045 1605 nt0.59□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 BFR1YOR198C 1413 nt0.59□□□□□ -2.31
YRF1-1P0CX20 YAP3YHL009C 993 nt0.59□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 AIM41YOR215C 558 nt0.59□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 YDR042CYDR042C 603 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 YFR054CYFR054C 579 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 YMR147WYMR147W 672 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 YNL089CYNL089C 477 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 YOR152CYOR152C 771 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 ADF1YCL058W-A 342 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 AZF1YOR113W 2745 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 MDM36YPR083W 1740 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 NIP100YPL174C 2607 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 BTN2YGR142W 1233 nt0.57□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 RPL40AYIL148W 387 nt0.57□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 CYB5YNL111C 363 nt0.57□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 PEX15YOL044W 1152 nt0.57□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 ALK1YGL021W 2283 nt0.57□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 PRS3YHL011C 963 nt0.57□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 snR14snR14 160 nt0.57□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 ARL3YPL051W 597 nt0.57□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 MRPL40YPL173W 894 nt0.57□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 DGR2YKL121W 2559 nt0.56□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 YDR286CYDR286C 345 nt0.56□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 RAM2YKL019W 951 nt0.56□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt0.56□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt0.56□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 FUS2YMR232W 2034 nt0.56□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 YER091C-AYER091C-A 222 nt0.55□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 PSO2YMR137C 1986 nt0.55□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 NCA2YPR155C 1851 nt0.55□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 HOP2YGL033W 657 nt0.55□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 YAL069WYAL069W 315 nt0.55□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 YPR014CYPR014C 330 nt0.55□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 ENV11YGR071C 2583 nt0.54□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 MVP1YMR004W 1536 nt0.54□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt0.54□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 SMD1YGR074W 441 nt0.54□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 RPB5YBR154C 648 nt0.54□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 SAS3YBL052C 2496 nt0.53□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 MFA1YDR461W 111 nt0.53□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 YGR250CYGR250C 2346 nt0.53□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 NUP120YKL057C 3114 nt0.53□□□□□ -2.32
YRF1-1P0CX20 MUK1YPL070W 1839 nt0.53□□□□□ -2.33
YRF1-1P0CX20 YML047W-AYML047W-A 366 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-1P0CX20 RIM20YOR275C 1986 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-1P0CX20 NOP12YOL041C 1380 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-1P0CX20 RPL35BYDL136W 363 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-1P0CX20 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-1P0CX20 YIL141WYIL141W 390 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-1P0CX20 MRPL24YMR193W 777 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-1P0CX20 RRT16YNL105W 429 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-1P0CX20 SST2YLR452C 2097 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-1P0CX20 RPL9AYGL147C 576 nt0.51□□□□□ -2.33
YRF1-1P0CX20 AHC2YCR082W 387 nt0.5□□□□□ -2.33
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