Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms