Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sh3bgrlQ9JJU8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrlQ9JJU8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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