Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snapc4Q8BP86 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snapc4Q8BP86 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms