Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot1Q6ZQ08 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot1Q6ZQ08 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms