Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm10Q3UTQ7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm10Q3UTQ7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms