Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TchpQ3TVW5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TchpQ3TVW5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TchpQ3TVW5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TchpQ3TVW5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TchpQ3TVW5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TchpQ3TVW5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TchpQ3TVW5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TchpQ3TVW5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TchpQ3TVW5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TchpQ3TVW5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TchpQ3TVW5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TchpQ3TVW5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TchpQ3TVW5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TchpQ3TVW5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TchpQ3TVW5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TchpQ3TVW5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TchpQ3TVW5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TchpQ3TVW5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TchpQ3TVW5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TchpQ3TVW5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TchpQ3TVW5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TchpQ3TVW5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms