Protein–RNA interactions for Protein: Q3E811

RRT15, Regulator of rDNA transcription protein 15, yeastyeast

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT15Q3E811 NOP12YOL041C 1380 nt0.55□□□□□ -2.32
RRT15Q3E811 DGR2YKL121W 2559 nt0.54□□□□□ -2.32
RRT15Q3E811 YGR250CYGR250C 2346 nt0.54□□□□□ -2.32
RRT15Q3E811 YDR115WYDR115W 318 nt0.54□□□□□ -2.32
RRT15Q3E811 MEI4YER044C-A 1227 nt0.54□□□□□ -2.32
RRT15Q3E811 YFR054CYFR054C 579 nt0.54□□□□□ -2.32
RRT15Q3E811 YAP3YHL009C 993 nt0.54□□□□□ -2.32
RRT15Q3E811 YIL141WYIL141W 390 nt0.54□□□□□ -2.32
RRT15Q3E811 YLL020CYLL020C 306 nt0.54□□□□□ -2.32
RRT15Q3E811 CLU1YMR012W 3834 nt0.54□□□□□ -2.32
RRT15Q3E811 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.54□□□□□ -2.32
RRT15Q3E811 PEX15YOL044W 1152 nt0.54□□□□□ -2.32
RRT15Q3E811 SFM1YOR021C 642 nt0.54□□□□□ -2.32
RRT15Q3E811 SHS1YDL225W 1656 nt0.53□□□□□ -2.32
RRT15Q3E811 TRZ1YKR079C 2517 nt0.53□□□□□ -2.32
RRT15Q3E811 YDL211CYDL211C 1119 nt0.53□□□□□ -2.32
RRT15Q3E811 RNR4YGR180C 1038 nt0.53□□□□□ -2.32
RRT15Q3E811 YGR219WYGR219W 342 nt0.53□□□□□ -2.32
RRT15Q3E811 PEP8YJL053W 1140 nt0.53□□□□□ -2.32
RRT15Q3E811 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.53□□□□□ -2.32
RRT15Q3E811 EAF7YNL136W 1278 nt0.53□□□□□ -2.32
RRT15Q3E811 YNL179CYNL179C 438 nt0.53□□□□□ -2.32
RRT15Q3E811 YOR376WYOR376W 369 nt0.53□□□□□ -2.32
RRT15Q3E811 CIN2YPL241C 807 nt0.53□□□□□ -2.32
RRT15Q3E811 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.53□□□□□ -2.32
RRT15Q3E811 SLU7YDR088C 1149 nt0.52□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 GIC1YHR061C 945 nt0.52□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 FYV6YNL133C 522 nt0.52□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 YOR029WYOR029W 336 nt0.52□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 RRP7YCL031C 894 nt0.52□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 MMS22YLR320W 4365 nt0.52□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 OST5YGL226C-A 261 nt0.51□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 BTN2YGR142W 1233 nt0.51□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 YIP1YGR172C 747 nt0.51□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 FYV4YHR059W 393 nt0.51□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 RRT16YNL105W 429 nt0.51□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 PAC1YOR269W 1485 nt0.51□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 KAR9YPL269W 1935 nt0.51□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt0.5□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 NHP2YDL208W 471 nt0.5□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.5□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 NCL1YBL024W 2055 nt0.5□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 APL3YBL037W 3078 nt0.5□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 NSE3YDR288W 912 nt0.49□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 YGL177WYGL177W 348 nt0.49□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 INA22YIR024C 651 nt0.49□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 HYR1YIR037W 492 nt0.49□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.49□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 YNL010WYNL010W 726 nt0.49□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 YNL235CYNL235C 432 nt0.49□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 YPR117WYPR117W 7470 nt0.49□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 SHE4YOR035C 2370 nt0.48□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 YDR521WYDR521W 336 nt0.48□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 NOP10YHR072W-A 177 nt0.48□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 RPL16AYIL133C 600 nt0.48□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 CMC4YMR194C-B 222 nt0.48□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 YNL089CYNL089C 477 nt0.48□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 NTC20YBR188C 423 nt0.48□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 NUP157YER105C 4176 nt0.48□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 SEC5YDR166C 2916 nt0.48□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 OST1YJL002C 1431 nt0.47□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 VMR1YHL035C 4779 nt0.47□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 DAS1YJL149W 1992 nt0.47□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 RPL35BYDL136W 363 nt0.47□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 YDL157CYDL157C 357 nt0.47□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 STF2YGR008C 255 nt0.47□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.47□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 YIL089WYIL089W 618 nt0.47□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 RIF2YLR453C 1188 nt0.47□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.47□□□□□ -2.33
RRT15Q3E811 NUP188YML103C 4968 nt0.46□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 HUG1YML058W-A 207 nt0.46□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 URA10YMR271C 684 nt0.46□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 YNL226WYNL226W 411 nt0.46□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.46□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 ARL3YPL051W 597 nt0.46□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 RLM1YPL089C 2031 nt0.46□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 YML002WYML002W 2214 nt0.46□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 CDC24YAL041W 2565 nt0.46□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt0.45□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 YGL039WYGL039W 1047 nt0.45□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 PRM8YGL053W 714 nt0.45□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.45□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 MIX23YBL107C 591 nt0.45□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 IRC23YOR044W 474 nt0.45□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 RPS30BYOR182C 192 nt0.45□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 PIG2YIL045W 1617 nt0.45□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 ECM25YJL201W 1800 nt0.45□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 YLL007CYLL007C 1998 nt0.45□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.44□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.44□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.44□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.44□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.44□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.44□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.44□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.44□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.44□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.44□□□□□ -2.34
RRT15Q3E811 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.44□□□□□ -2.34
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