Protein–RNA interactions for Protein: Q12501

TY2B-OR2, Transposon Ty2-OR2 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-OR2Q12501 YPL035CYPL035C 348 nt0.57□□□□□ -2.32
TY2B-OR2Q12501 RXT2YBR095C 1293 nt0.57□□□□□ -2.32
TY2B-OR2Q12501 PRP39YML046W 1890 nt0.57□□□□□ -2.32
TY2B-OR2Q12501 PRK1YIL095W 2433 nt0.57□□□□□ -2.32
TY2B-OR2Q12501 GLC7YER133W 939 nt0.56□□□□□ -2.32
TY2B-OR2Q12501 YMR31YFR049W 372 nt0.56□□□□□ -2.32
TY2B-OR2Q12501 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt0.56□□□□□ -2.32
TY2B-OR2Q12501 YAR068WYAR068W 486 nt0.56□□□□□ -2.32
TY2B-OR2Q12501 BTN2YGR142W 1233 nt0.55□□□□□ -2.32
TY2B-OR2Q12501 NYV1YLR093C 762 nt0.55□□□□□ -2.32
TY2B-OR2Q12501 YLR400WYLR400W 474 nt0.55□□□□□ -2.32
TY2B-OR2Q12501 CUR1YPR158W 759 nt0.55□□□□□ -2.32
TY2B-OR2Q12501 CRM1YGR218W 3255 nt0.55□□□□□ -2.32
TY2B-OR2Q12501 TRM12YML005W 1389 nt0.55□□□□□ -2.32
TY2B-OR2Q12501 LRS4YDR439W 1044 nt0.55□□□□□ -2.32
TY2B-OR2Q12501 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt0.55□□□□□ -2.32
TY2B-OR2Q12501 SEC8YPR055W 3198 nt0.55□□□□□ -2.32
TY2B-OR2Q12501 SLK19YOR195W 2466 nt0.54□□□□□ -2.32
TY2B-OR2Q12501 YER189WYER189W 369 nt0.54□□□□□ -2.32
TY2B-OR2Q12501 YDR355CYDR355C 303 nt0.53□□□□□ -2.32
TY2B-OR2Q12501 MTC7YEL033W 420 nt0.53□□□□□ -2.32
TY2B-OR2Q12501 NOP53YPL146C 1368 nt0.53□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 YER091C-AYER091C-A 222 nt0.52□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 ATG38YLR211C 681 nt0.52□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 CPR3YML078W 549 nt0.52□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 CAF20YOR276W 486 nt0.52□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 YBR063CYBR063C 1215 nt0.52□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 CCL1YPR025C 1182 nt0.52□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 SNC2YOR327C 348 nt0.52□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 YPR063CYPR063C 423 nt0.52□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 NSE3YDR288W 912 nt0.51□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 YDR338CYDR338C 2088 nt0.51□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 CSE1YGL238W 2883 nt0.5□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 RNH202YDR279W 1053 nt0.5□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 FMN1YDR236C 657 nt0.5□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 RPL40AYIL148W 387 nt0.5□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 YIL161WYIL161W 708 nt0.5□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 ASM4YDL088C 1587 nt0.49□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 POL4YCR014C 1749 nt0.49□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 YSW1YBR148W 1830 nt0.49□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 COX1Q0045 1605 nt0.49□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 YGR273CYGR273C 525 nt0.49□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 RIF2YLR453C 1188 nt0.49□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 NSE4YDL105W 1209 nt0.48□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 SPO74YGL170C 1242 nt0.48□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 YGL177WYGL177W 348 nt0.48□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt0.48□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 YBL029WYBL029W 1131 nt0.48□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 CSI2YOL007C 1026 nt0.48□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 SPP381YBR152W 876 nt0.48□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 RGI1YER067W 486 nt0.47□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 YMR181CYMR181C 465 nt0.47□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 YML002WYML002W 2214 nt0.47□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 YGR190CYGR190C 366 nt0.47□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 SPC1YJR010C-A 285 nt0.47□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 YKL177WYKL177W 339 nt0.47□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 GIM3YNL153C 390 nt0.47□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 YNL179CYNL179C 438 nt0.47□□□□□ -2.33
TY2B-OR2Q12501 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt0.46□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 UFE1YOR075W 1041 nt0.46□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.46□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 MYO1YHR023W 5787 nt0.46□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 PES4YFR023W 1836 nt0.46□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 MUK1YPL070W 1839 nt0.46□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 CLB5YPR120C 1308 nt0.46□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 ACA1YER045C 1470 nt0.45□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 VPS55YJR044C 423 nt0.45□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 ATG10YLL042C 504 nt0.45□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 AZF1YOR113W 2745 nt0.45□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 YIP1YGR172C 747 nt0.45□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 CLG1YGL215W 1359 nt0.44□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 NCA2YPR155C 1851 nt0.44□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 YEA4YEL004W 1029 nt0.44□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 SVP26YHR181W 687 nt0.44□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 HIR3YJR140C 4947 nt0.44□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 YJL022WYJL022W 309 nt0.43□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 MRP49YKL167C 414 nt0.43□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 ARK1YNL020C 1917 nt0.42□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 WHI3YNL197C 1986 nt0.42□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 YCR108CYCR108C 192 nt0.42□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt0.42□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 PET123YOR158W 957 nt0.42□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 WAR1YML076C 2835 nt0.41□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 APC5YOR249C 2058 nt0.41□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 CTL1YMR180C 963 nt0.41□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt0.41□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 LYS14YDR034C 2373 nt0.41□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 ALK1YGL021W 2283 nt0.4□□□□□ -2.34
TY2B-OR2Q12501 EPT1YHR123W 1176 nt0.4□□□□□ -2.35
TY2B-OR2Q12501 MUM3YOR298W 1440 nt0.4□□□□□ -2.35
TY2B-OR2Q12501 YNL010WYNL010W 726 nt0.4□□□□□ -2.35
TY2B-OR2Q12501 DGR2YKL121W 2559 nt0.39□□□□□ -2.35
TY2B-OR2Q12501 DIG2YDR480W 972 nt0.39□□□□□ -2.35
TY2B-OR2Q12501 PRS3YHL011C 963 nt0.39□□□□□ -2.35
TY2B-OR2Q12501 PRM6YML047C 1059 nt0.39□□□□□ -2.35
TY2B-OR2Q12501 NGL1YOL042W 1092 nt0.39□□□□□ -2.35
TY2B-OR2Q12501 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.39□□□□□ -2.35
TY2B-OR2Q12501 snR45snR45 172 nt0.39□□□□□ -2.35
TY2B-OR2Q12501 SNA4YDL123W 423 nt0.38□□□□□ -2.35
TY2B-OR2Q12501 EDC1YGL222C 528 nt0.38□□□□□ -2.35
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