Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 DPB11YJL090C 2295 nt2.02□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 PET309YLR067C 2898 nt2.02□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 CFT2YLR115W 2580 nt2.02□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 snR9snR9 187 nt2.02□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.02□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 PAU14YIL176C 363 nt2.02□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 YJL119CYJL119C 324 nt2.02□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 PAU1YJL223C 363 nt2.02□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 CMS1YLR003C 876 nt2.02□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 RLP24YLR009W 600 nt2.02□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 YBR063CYBR063C 1215 nt2.02□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 UBP1YDL122W 2430 nt2.02□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 NAB6YML117W 3405 nt2.02□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 GCN2YDR283C 4980 nt2.02□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 APL5YPL195W 2799 nt2.01□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 BFA1YJR053W 1725 nt2.01□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 GRX8YLR364W 330 nt2.01□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 HCS1YKL017C 2052 nt2.01□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 DFG16YOR030W 1860 nt2.01□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 RNH70YGR276C 1662 nt2□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 PEA2YER149C 1263 nt2□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 YHR210CYHR210C 1026 nt2□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 RPL37AYLR185W 267 nt2□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 CSI1YMR025W 888 nt2□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 BI4Q0120 1917 nt1.99□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 MDM32YOR147W 1869 nt1.99□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 RIC1YLR039C 3171 nt1.99□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 RPH1YER169W 2391 nt1.99□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 TMA20YER007C-A 546 nt1.99□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 BRP1YGL007W 378 nt1.99□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 HOP2YGL033W 657 nt1.99□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 RPB11YOL005C 363 nt1.99□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 VTC3YPL019C 2508 nt1.99□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 UTP22YGR090W 3714 nt1.99□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 SPO22YIL073C 2928 nt1.99□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 STB4YMR019W 2850 nt1.98□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 BRE1YDL074C 2103 nt1.98□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 GCN4YEL009C 846 nt1.98□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt1.98□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 LRP1YHR081W 555 nt1.98□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 AIM19YIL087C 474 nt1.98□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 YHC1YLR298C 696 nt1.98□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 URA10YMR271C 684 nt1.98□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 PHO80YOL001W 882 nt1.98□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 YCL007CYCL007C 393 nt1.98□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 NUP170YBL079W 4509 nt1.98□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 ALK2YBL009W 2031 nt1.98□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 CHZ1YER030W 462 nt1.97□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 ICY1YMR195W 384 nt1.97□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 USO1YDL058W 5373 nt1.97□□□□□ -2.09
NFI1Q12216 YGL015CYGL015C 393 nt1.96□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 VOA1YGR106C 798 nt1.96□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 RPI1YIL119C 1224 nt1.96□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt1.96□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 PRP21YJL203W 843 nt1.96□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt1.96□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 YPL039WYPL039W 951 nt1.96□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt1.96□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 ROX1YPR065W 1107 nt1.96□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 MUD1YBR119W 897 nt1.96□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 IRA2YOL081W 9240 nt1.95□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 ADR1YDR216W 3972 nt1.95□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 GPM2YDL021W 936 nt1.95□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 YDL062WYDL062W 426 nt1.95□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 YDL068WYDL068W 330 nt1.94□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 VMA21YGR105W 234 nt1.94□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 BUD19YJL188C 309 nt1.94□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 SNC2YOR327C 348 nt1.94□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 VPS41YDR080W 2979 nt1.94□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 UTP21YLR409C 2820 nt1.94□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 BNA7YDR428C 786 nt1.93□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 RPS24AYER074W 408 nt1.93□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 SNO3YFL060C 669 nt1.93□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 TIM10YHR005C-A 282 nt1.93□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 YMR254CYMR254C 309 nt1.93□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 YNL050CYNL050C 813 nt1.93□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 SNO2YNL334C 669 nt1.93□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 RPL36BYPL249C-A 303 nt1.93□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 CDC27YBL084C 2277 nt1.93□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 NUP120YKL057C 3114 nt1.92□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 YER175W-AYER175W-A 165 nt1.92□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt1.92□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 SLX9YGR081C 633 nt1.92□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 YJR087WYJR087W 351 nt1.92□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt1.92□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 YLR031WYLR031W 561 nt1.92□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt1.92□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 CYB5YNL111C 363 nt1.92□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 YPL238CYPL238C 390 nt1.92□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 VPS35YJL154C 2835 nt1.92□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.91□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 SSQ1YLR369W 1974 nt1.91□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 AFR1YDR085C 1863 nt1.91□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.91□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt1.91□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 SCEIQ0160 708 nt1.91□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt1.91□□□□□ -2.1
NFI1Q12216 YAP5YIR018W 738 nt1.91□□□□□ -2.1
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