Protein–RNA interactions for Protein: Q12074

SPE3, Spermidine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3Q12074 YHC1YLR298C 696 nt2.21□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 YPL039WYPL039W 951 nt2.21□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 YPR096CYPR096C 303 nt2.21□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 SAP185YJL098W 3177 nt2.21□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 UFD4YKL010C 4452 nt2.21□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 YFR016CYFR016C 3702 nt2.2□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 DPB11YJL090C 2295 nt2.2□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 OCA6YDR067C 675 nt2.2□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 YGL015CYGL015C 393 nt2.2□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 RPL40AYIL148W 387 nt2.2□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.2□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 MET18YIL128W 3099 nt2.2□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 BRE1YDL074C 2103 nt2.2□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 YOR105WYOR105W 327 nt2.19□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 IST2YBR086C 2841 nt2.19□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 NIC96YFR002W 2520 nt2.19□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 NAN1YPL126W 2691 nt2.18□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 VPH1YOR270C 2523 nt2.18□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 MCD1YDL003W 1701 nt2.18□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 CDC50YCR094W 1176 nt2.18□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.18□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 DAD4YDR320C-A 219 nt2.18□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 IRC4YDR540C 540 nt2.18□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 MSL1YIR009W 336 nt2.18□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 YIR020CYIR020C 303 nt2.18□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 CMS1YLR003C 876 nt2.18□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 YLR252WYLR252W 306 nt2.18□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 GMC2YLR445W 567 nt2.18□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.18□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 CDC53YDL132W 2448 nt2.17□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.17□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 RNR4YGR180C 1038 nt2.17□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.17□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.17□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 LSM7YNL147W 348 nt2.17□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 TOA1YOR194C 861 nt2.17□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 MMS22YLR320W 4365 nt2.16□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 FKS1YLR342W 5631 nt2.16□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 CRD1YDL142C 852 nt2.16□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 SNC1YAL030W 354 nt2.16□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.16□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 RTT101YJL047C 2529 nt2.16□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 MPH1YIR002C 2982 nt2.16□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 TRL1YJL087C 2484 nt2.15□□□□□ -2.06
SPE3Q12074 UBC5YDR059C 447 nt2.15□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 SPO13YHR014W 876 nt2.15□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 AFB1YLR040C 675 nt2.15□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 RPL37AYLR185W 267 nt2.15□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 URA10YMR271C 684 nt2.15□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 YNR025CYNR025C 360 nt2.15□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 RPB11YOL005C 363 nt2.15□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 UBP2YOR124C 3819 nt2.15□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 MDM32YOR147W 1869 nt2.15□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 SPE1YKL184W 1401 nt2.15□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 NOP14YDL148C 2433 nt2.15□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 CDC60YPL160W 3273 nt2.15□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 RTT107YHR154W 3213 nt2.14□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 TIM10YHR005C-A 282 nt2.14□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 YIL029CYIL029C 429 nt2.14□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.14□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 SWS2YNL081C 432 nt2.14□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 YOR333CYOR333C 417 nt2.14□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 RUD3YOR216C 1455 nt2.14□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 NOP10YHR072W-A 177 nt2.13□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 YNL010WYNL010W 726 nt2.13□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 SOK2YMR016C 2358 nt2.13□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 MNE1YOR350C 1992 nt2.12□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 MZM1YDR493W 372 nt2.12□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.12□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 HER1YOR227W 3741 nt2.12□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 SPC1YJR010C-A 285 nt2.11□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 YLR271WYLR271W 825 nt2.11□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 CSI1YMR025W 888 nt2.11□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 snR189snR189 189 nt2.11□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 RPB5YBR154C 648 nt2.11□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 BFA1YJR053W 1725 nt2.11□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 IPT1YDR072C 1584 nt2.1□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 PET309YLR067C 2898 nt2.1□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 SPC72YAL047C 1869 nt2.1□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 SMD1YGR074W 441 nt2.1□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 GRX8YLR364W 330 nt2.1□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 DGR1YNL130C-A 147 nt2.1□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 PHO80YOL001W 882 nt2.1□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 YPR172WYPR172W 603 nt2.1□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 VPS8YAL002W 3825 nt2.1□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 SPP41YDR464W 4308 nt2.1□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 COS111YBR203W 2775 nt2.1□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 UTP13YLR222C 2454 nt2.09□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 CRM1YGR218W 3255 nt2.09□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 HNT1YDL125C 477 nt2.09□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 SIP18YMR175W 240 nt2.09□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 RPS7BYNL096C 573 nt2.09□□□□□ -2.07
SPE3Q12074 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt2.09□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 RGA1YOR127W 3024 nt2.09□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.08□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 SCH9YHR205W 2475 nt2.08□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 RTR2YDR066C 591 nt2.08□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 BNA7YDR428C 786 nt2.08□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 ANS1YHR126C 480 nt2.08□□□□□ -2.08
SPE3Q12074 TIM8YJR135W-A 264 nt2.08□□□□□ -2.08
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