Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 MSL5YLR116W 1431 nt2.25□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 AHC2YCR082W 387 nt2.24□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.24□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 SPC1YJR010C-A 285 nt2.24□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 URA10YMR271C 684 nt2.24□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.24□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 REV1YOR346W 2958 nt2.24□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 RAV1YJR033C 4074 nt2.24□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 STH1YIL126W 4080 nt2.23□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 MET32YDR253C 576 nt2.23□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 IRC4YDR540C 540 nt2.23□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 GIC1YHR061C 945 nt2.23□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 RPS17AYML024W 411 nt2.23□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 CSI1YMR025W 888 nt2.23□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 TOA1YOR194C 861 nt2.23□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 YPR172WYPR172W 603 nt2.23□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 SSQ1YLR369W 1974 nt2.23□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 IRC8YJL051W 2469 nt2.23□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 NUP120YKL057C 3114 nt2.22□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 PUT3YKL015W 2940 nt2.22□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 SEC16YPL085W 6588 nt2.22□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 RSA1YPL193W 1146 nt2.22□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 YBR071WYBR071W 636 nt2.22□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 SPE1YKL184W 1401 nt2.22□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 MET18YIL128W 3099 nt2.22□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 UFD4YKL010C 4452 nt2.22□□□□□ -2.05
VPS54Q12071 SAP185YJL098W 3177 nt2.21□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 SSD1YDR293C 3753 nt2.21□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 NCL1YBL024W 2055 nt2.21□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 HNT1YDL125C 477 nt2.21□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 RPL27BYDR471W 411 nt2.21□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 YEL057CYEL057C 702 nt2.21□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 YKL044WYKL044W 321 nt2.21□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 VTI1YMR197C 654 nt2.21□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 LSM7YNL147W 348 nt2.21□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 PHO80YOL001W 882 nt2.21□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 SAC3YDR159W 3906 nt2.21□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 YJL070CYJL070C 2667 nt2.2□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.2□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 MSL1YIR009W 336 nt2.2□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 UBX4YMR067C 1251 nt2.2□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 YCL023CYCL023C 348 nt2.2□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 MPH1YIR002C 2982 nt2.2□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 YFR016CYFR016C 3702 nt2.2□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 IST2YBR086C 2841 nt2.19□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 UBR1YGR184C 5853 nt2.19□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 TAE2YPL009C 3117 nt2.19□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.19□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 PRM8YGL053W 714 nt2.19□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 RPL37AYLR185W 267 nt2.19□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 CCW14YLR390W-A 717 nt2.19□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 YPL039WYPL039W 951 nt2.19□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.19□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 UTP13YLR222C 2454 nt2.19□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 SSY1YDR160W 2559 nt2.19□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 CDC53YDL132W 2448 nt2.19□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 ATG11YPR049C 3537 nt2.18□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 RRP6YOR001W 2202 nt2.18□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 CRD1YDL142C 852 nt2.18□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 RTR2YDR066C 591 nt2.18□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.18□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 EMP24YGL200C 612 nt2.18□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.17□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 YDR220CYDR220C 294 nt2.17□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 CAJ1YER048C 1176 nt2.17□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 CIC1YHR052W 1131 nt2.17□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 RPS7BYNL096C 573 nt2.17□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 SVS1YPL163C 783 nt2.17□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 IPT1YDR072C 1584 nt2.17□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 PHR1YOR386W 1698 nt2.17□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 GIP3YPL137C 3831 nt2.16□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 DAD4YDR320C-A 219 nt2.16□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 TIM8YJR135W-A 264 nt2.16□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 YLR379WYLR379W 375 nt2.16□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 DGR1YNL130C-A 147 nt2.16□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 YPL197CYPL197C 414 nt2.16□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 MSS18YPR134W 807 nt2.16□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 LOA1YPR139C 903 nt2.16□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 RRP12YPL012W 3687 nt2.15□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 BRE1YDL074C 2103 nt2.15□□□□□ -2.06
VPS54Q12071 RTT107YHR154W 3213 nt2.15□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 COS111YBR203W 2775 nt2.15□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt2.15□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt2.15□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 NOP10YHR072W-A 177 nt2.15□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 GRX8YLR364W 330 nt2.15□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 SIP18YMR175W 240 nt2.15□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 ROX1YPR065W 1107 nt2.15□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 YDL068WYDL068W 330 nt2.14□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 SMD1YGR074W 441 nt2.14□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 EAF6YJR082C 342 nt2.14□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 SPP41YDR464W 4308 nt2.13□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 VOA1YGR106C 798 nt2.13□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 APQ13YJL075C 417 nt2.13□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.13□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 ATP15YPL271W 189 nt2.13□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 KAP123YER110C 3342 nt2.13□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 SNU56YDR240C 1479 nt2.13□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 NUP82YJL061W 2142 nt2.12□□□□□ -2.07
VPS54Q12071 GYP5YPL249C 2685 nt2.12□□□□□ -2.07
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