Protein–RNA interactions for Protein: Q04839

GFD1, mRNA transport factor GFD1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GFD1Q04839 MAM33YIL070C 801 nt2.84□□□□□ -1.95
GFD1Q04839 YPL238CYPL238C 390 nt2.84□□□□□ -1.95
GFD1Q04839 CWC22YGR278W 1734 nt2.84□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 YNL034WYNL034W 1839 nt2.84□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 RIF1YBR275C 5751 nt2.83□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 DIA2YOR080W 2199 nt2.83□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 PDR1YGL013C 3207 nt2.83□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 BAT1YHR208W 1182 nt2.83□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt2.83□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 YDL152WYDL152W 366 nt2.82□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 YNL043CYNL043C 321 nt2.82□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 RPS12YOR369C 432 nt2.82□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 YJR003CYJR003C 1560 nt2.82□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 YDR366CYDR366C 399 nt2.81□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 YDR413CYDR413C 576 nt2.81□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.81□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 NCE101YJL205C 162 nt2.81□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 PRE8YML092C 753 nt2.81□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 MRD1YPR112C 2664 nt2.81□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 ARP8YOR141C 2646 nt2.8□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 YCR022CYCR022C 345 nt2.8□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 YDR102CYDR102C 333 nt2.8□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 URM1YIL008W 300 nt2.8□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.8□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 PAU14YIL176C 363 nt2.8□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 PAU1YJL223C 363 nt2.8□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 GPI14YJR013W 1212 nt2.8□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 TIM18YOR297C 579 nt2.8□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt2.8□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 NUM1YDR150W 8247 nt2.8□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 NDD1YOR372C 1665 nt2.79□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.79□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt2.79□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 COX7YMR256C 183 nt2.79□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 ATP3YBR039W 936 nt2.79□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 ROX1YPR065W 1107 nt2.79□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 PTP3YER075C 2787 nt2.79□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 SAP1YER047C 2694 nt2.79□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 SKT5YBL061C 2091 nt2.78□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 PSK1YAL017W 4071 nt2.78□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 SDC1YDR469W 528 nt2.78□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.78□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.78□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 EXO84YBR102C 2262 nt2.78□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 ATP22YDR350C 2055 nt2.78□□□□□ -1.96
GFD1Q04839 TAF2YCR042C 4224 nt2.77□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YMR31YFR049W 372 nt2.77□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.77□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YIL058WYIL058W 285 nt2.77□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YOR055WYOR055W 435 nt2.77□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 COX1Q0045 1605 nt2.77□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.76□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 APC11YDL008W 498 nt2.76□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.76□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.76□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.76□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.76□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.76□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.76□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 NUP82YJL061W 2142 nt2.76□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YJL202CYJL202C 348 nt2.76□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 KEL2YGR238C 2649 nt2.76□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 VPS52YDR484W 1926 nt2.76□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 TPS2YDR074W 2691 nt2.75□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 BOI1YBL085W 2943 nt2.75□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 SRB8YCR081W 4284 nt2.75□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 SIP3YNL257C 3690 nt2.75□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 TIM11YDR322C-A 291 nt2.75□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YFR056CYFR056C 369 nt2.75□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 HYR1YIR037W 492 nt2.75□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 RPL20AYMR242C 519 nt2.75□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YOR050CYOR050C 348 nt2.75□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.75□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.75□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.75□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.75□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YER138CYER138C 5268 nt2.75□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YER160CYER160C 5268 nt2.75□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.75□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.75□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YJR027WYJR027W 5268 nt2.75□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.75□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YML039WYML039W 5268 nt2.75□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YML045WYML045W 5268 nt2.75□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YMR050CYMR050C 5268 nt2.75□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.75□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.75□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.75□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.75□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.75□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YSW1YBR148W 1830 nt2.75□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 ESC1YMR219W 4977 nt2.74□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 ECM5YMR176W 4236 nt2.74□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 snR65snR65 100 nt2.74□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YDL041WYDL041W 354 nt2.74□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 RPS17BYDR447C 411 nt2.74□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YAR053WYAR053W 297 nt2.74□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 AIM32YML050W 936 nt2.74□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt2.74□□□□□ -1.97
GFD1Q04839 COG3YER157W 2406 nt2.74□□□□□ -1.97
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