Protein–RNA interactions for Protein: P40550

PDR11, ATP-dependent permease PDR11, yeastyeast

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR11P40550 PES4YFR023W 1836 nt0.96□□□□□ -2.26
PDR11P40550 GTR2YGR163W 1026 nt0.95□□□□□ -2.26
PDR11P40550 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt0.95□□□□□ -2.26
PDR11P40550 FCF2YLR051C 654 nt0.95□□□□□ -2.26
PDR11P40550 GPN3YLR243W 819 nt0.95□□□□□ -2.26
PDR11P40550 YAR068WYAR068W 486 nt0.95□□□□□ -2.26
PDR11P40550 EST2YLR318W 2655 nt0.95□□□□□ -2.26
PDR11P40550 HMI1YOL095C 2121 nt0.94□□□□□ -2.26
PDR11P40550 JJJ2YJL162C 1752 nt0.94□□□□□ -2.26
PDR11P40550 CDC27YBL084C 2277 nt0.94□□□□□ -2.26
PDR11P40550 TCA17YEL048C 459 nt0.94□□□□□ -2.26
PDR11P40550 BNA7YDR428C 786 nt0.93□□□□□ -2.26
PDR11P40550 CIC1YHR052W 1131 nt0.93□□□□□ -2.26
PDR11P40550 YOR152CYOR152C 771 nt0.93□□□□□ -2.26
PDR11P40550 CRM1YGR218W 3255 nt0.93□□□□□ -2.26
PDR11P40550 GCD2YGR083C 1956 nt0.93□□□□□ -2.26
PDR11P40550 HSE1YHL002W 1359 nt0.93□□□□□ -2.26
PDR11P40550 DIG2YDR480W 972 nt0.92□□□□□ -2.26
PDR11P40550 RPL16AYIL133C 600 nt0.92□□□□□ -2.26
PDR11P40550 SRL4YPL033C 846 nt0.92□□□□□ -2.26
PDR11P40550 YPR014CYPR014C 330 nt0.92□□□□□ -2.26
PDR11P40550 MUM3YOR298W 1440 nt0.92□□□□□ -2.26
PDR11P40550 CTF18YMR078C 2226 nt0.92□□□□□ -2.26
PDR11P40550 NCL1YBL024W 2055 nt0.91□□□□□ -2.26
PDR11P40550 FSH1YHR049W 732 nt0.91□□□□□ -2.26
PDR11P40550 YIL161WYIL161W 708 nt0.91□□□□□ -2.26
PDR11P40550 PEX27YOR193W 1131 nt0.91□□□□□ -2.26
PDR11P40550 FIG1YBR040W 897 nt0.91□□□□□ -2.26
PDR11P40550 KAP120YPL125W 3099 nt0.91□□□□□ -2.26
PDR11P40550 UPF3YGR072W 1164 nt0.9□□□□□ -2.26
PDR11P40550 SNC1YAL030W 354 nt0.9□□□□□ -2.26
PDR11P40550 CTK3YML112W 891 nt0.9□□□□□ -2.26
PDR11P40550 YCS4YLR272C 3531 nt0.9□□□□□ -2.26
PDR11P40550 STE5YDR103W 2754 nt0.9□□□□□ -2.27
PDR11P40550 KAP122YGL016W 3246 nt0.89□□□□□ -2.27
PDR11P40550 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.89□□□□□ -2.27
PDR11P40550 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.89□□□□□ -2.27
PDR11P40550 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
PDR11P40550 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.89□□□□□ -2.27
PDR11P40550 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
PDR11P40550 BET5YML077W 480 nt0.89□□□□□ -2.27
PDR11P40550 CTR9YOL145C 3234 nt0.89□□□□□ -2.27
PDR11P40550 COG8YML071C 1824 nt0.89□□□□□ -2.27
PDR11P40550 AIM6YDL237W 1173 nt0.89□□□□□ -2.27
PDR11P40550 YFR056CYFR056C 369 nt0.89□□□□□ -2.27
PDR11P40550 CUP9YPL177C 921 nt0.89□□□□□ -2.27
PDR11P40550 LDH1YBR204C 1128 nt0.89□□□□□ -2.27
PDR11P40550 COX1Q0045 1605 nt0.88□□□□□ -2.27
PDR11P40550 ASM4YDL088C 1587 nt0.88□□□□□ -2.27
PDR11P40550 SEC1YDR164C 2175 nt0.88□□□□□ -2.27
PDR11P40550 IFH1YLR223C 3258 nt0.88□□□□□ -2.27
PDR11P40550 RMD5YDR255C 1266 nt0.88□□□□□ -2.27
PDR11P40550 YIL012WYIL012W 342 nt0.88□□□□□ -2.27
PDR11P40550 SWI6YLR182W 2412 nt0.87□□□□□ -2.27
PDR11P40550 STB4YMR019W 2850 nt0.87□□□□□ -2.27
PDR11P40550 YNL034WYNL034W 1839 nt0.87□□□□□ -2.27
PDR11P40550 YGL118CYGL118C 438 nt0.87□□□□□ -2.27
PDR11P40550 RPS18BYML026C 441 nt0.87□□□□□ -2.27
PDR11P40550 NOP53YPL146C 1368 nt0.86□□□□□ -2.27
PDR11P40550 RPL6BYLR448W 531 nt0.86□□□□□ -2.27
PDR11P40550 YSP1YHR155W 3687 nt0.86□□□□□ -2.27
PDR11P40550 YLR149CYLR149C 2193 nt0.85□□□□□ -2.27
PDR11P40550 VOA1YGR106C 798 nt0.84□□□□□ -2.27
PDR11P40550 CDC50YCR094W 1176 nt0.83□□□□□ -2.28
PDR11P40550 YDL062WYDL062W 426 nt0.83□□□□□ -2.28
PDR11P40550 MTC7YEL033W 420 nt0.83□□□□□ -2.28
PDR11P40550 HOP2YGL033W 657 nt0.83□□□□□ -2.28
PDR11P40550 YLR402WYLR402W 192 nt0.83□□□□□ -2.28
PDR11P40550 RKR1YMR247C 4689 nt0.83□□□□□ -2.28
PDR11P40550 MER1YNL210W 813 nt0.83□□□□□ -2.28
PDR11P40550 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt0.83□□□□□ -2.28
PDR11P40550 YSW1YBR148W 1830 nt0.83□□□□□ -2.28
PDR11P40550 CET1YPL228W 1650 nt0.83□□□□□ -2.28
PDR11P40550 PCL2YDL127W 927 nt0.82□□□□□ -2.28
PDR11P40550 YDR042CYDR042C 603 nt0.81□□□□□ -2.28
PDR11P40550 DSE1YER124C 1722 nt0.81□□□□□ -2.28
PDR11P40550 PPN1YDR452W 2025 nt0.81□□□□□ -2.28
PDR11P40550 UBP11YKR098C 2154 nt0.81□□□□□ -2.28
PDR11P40550 snR68snR68 136 nt0.81□□□□□ -2.28
PDR11P40550 NBL1YHR199C-A 222 nt0.81□□□□□ -2.28
PDR11P40550 CSI2YOL007C 1026 nt0.81□□□□□ -2.28
PDR11P40550 HIR3YJR140C 4947 nt0.8□□□□□ -2.28
PDR11P40550 NCA2YPR155C 1851 nt0.8□□□□□ -2.28
PDR11P40550 YJL022WYJL022W 309 nt0.8□□□□□ -2.28
PDR11P40550 PET123YOR158W 957 nt0.8□□□□□ -2.28
PDR11P40550 snR14snR14 160 nt0.8□□□□□ -2.28
PDR11P40550 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt0.79□□□□□ -2.28
PDR11P40550 snR35snR35 204 nt0.79□□□□□ -2.28
PDR11P40550 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.78□□□□□ -2.28
PDR11P40550 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt0.78□□□□□ -2.28
PDR11P40550 VPS55YJR044C 423 nt0.78□□□□□ -2.28
PDR11P40550 YPR063CYPR063C 423 nt0.78□□□□□ -2.28
PDR11P40550 SPR3YGR059W 1539 nt0.78□□□□□ -2.28
PDR11P40550 BPH1YCR032W 6504 nt0.77□□□□□ -2.29
PDR11P40550 SHS1YDL225W 1656 nt0.77□□□□□ -2.29
PDR11P40550 DYN3YMR299C 939 nt0.77□□□□□ -2.29
PDR11P40550 CYB5YNL111C 363 nt0.77□□□□□ -2.29
PDR11P40550 ALK1YGL021W 2283 nt0.77□□□□□ -2.29
PDR11P40550 YHL012WYHL012W 1482 nt0.77□□□□□ -2.29
PDR11P40550 YCR015CYCR015C 954 nt0.76□□□□□ -2.29
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