Protein–RNA interactions for Protein: P40489

XBP1, Transcriptional repressor XBP1, yeastyeast

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Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
XBP1P40489 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt2.7□□□□□ -1.98
XBP1P40489 YOR050CYOR050C 348 nt2.7□□□□□ -1.98
XBP1P40489 HHF1YBR009C 312 nt2.7□□□□□ -1.98
XBP1P40489 RSE1YML049C 4086 nt2.69□□□□□ -1.98
XBP1P40489 SPO71YDR104C 3738 nt2.69□□□□□ -1.98
XBP1P40489 FAA2YER015W 2235 nt2.69□□□□□ -1.98
XBP1P40489 VAS1YGR094W 3315 nt2.69□□□□□ -1.98
XBP1P40489 RPN1YHR027C 2982 nt2.69□□□□□ -1.98
XBP1P40489 YGL041CYGL041C 204 nt2.69□□□□□ -1.98
XBP1P40489 ALG13YGL047W 609 nt2.69□□□□□ -1.98
XBP1P40489 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.69□□□□□ -1.98
XBP1P40489 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.69□□□□□ -1.98
XBP1P40489 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.69□□□□□ -1.98
XBP1P40489 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.69□□□□□ -1.98
XBP1P40489 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt2.69□□□□□ -1.98
XBP1P40489 HEM4YOR278W 828 nt2.69□□□□□ -1.98
XBP1P40489 TRZ1YKR079C 2517 nt2.69□□□□□ -1.98
XBP1P40489 ARP7YPR034W 1434 nt2.68□□□□□ -1.98
XBP1P40489 URB2YJR041C 3525 nt2.68□□□□□ -1.98
XBP1P40489 YDL011CYDL011C 324 nt2.68□□□□□ -1.98
XBP1P40489 RPL35AYDL191W 363 nt2.68□□□□□ -1.98
XBP1P40489 YDL211CYDL211C 1119 nt2.68□□□□□ -1.98
XBP1P40489 ABF2YMR072W 552 nt2.68□□□□□ -1.98
XBP1P40489 CCT7YJL111W 1653 nt2.68□□□□□ -1.98
XBP1P40489 BCH1YMR237W 2175 nt2.68□□□□□ -1.98
XBP1P40489 MAK21YDR060W 3078 nt2.68□□□□□ -1.98
XBP1P40489 ENA5YDR038C 3276 nt2.68□□□□□ -1.98
XBP1P40489 CIN8YEL061C 3003 nt2.68□□□□□ -1.98
XBP1P40489 MCD1YDL003W 1701 nt2.68□□□□□ -1.98
XBP1P40489 CWC22YGR278W 1734 nt2.68□□□□□ -1.98
XBP1P40489 DOA4YDR069C 2781 nt2.67□□□□□ -1.98
XBP1P40489 BUD4YJR092W 4344 nt2.67□□□□□ -1.98
XBP1P40489 YLL032CYLL032C 2478 nt2.67□□□□□ -1.98
XBP1P40489 DYN1YKR054C 12279 nt2.67□□□□□ -1.98
XBP1P40489 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt2.67□□□□□ -1.98
XBP1P40489 TMA22YJR014W 597 nt2.67□□□□□ -1.98
XBP1P40489 COX14YML129C 213 nt2.67□□□□□ -1.98
XBP1P40489 YLR278CYLR278C 4026 nt2.67□□□□□ -1.98
XBP1P40489 KHA1YJL094C 2622 nt2.67□□□□□ -1.98
XBP1P40489 CIN1YOR349W 3045 nt2.66□□□□□ -1.98
XBP1P40489 ARK1YNL020C 1917 nt2.66□□□□□ -1.98
XBP1P40489 PRK1YIL095W 2433 nt2.66□□□□□ -1.98
XBP1P40489 HTL1YCR020W-B 237 nt2.66□□□□□ -1.98
XBP1P40489 ADK1YDR226W 669 nt2.66□□□□□ -1.98
XBP1P40489 DAD4YDR320C-A 219 nt2.66□□□□□ -1.98
XBP1P40489 RPL14BYHL001W 417 nt2.66□□□□□ -1.98
XBP1P40489 RSM19YNR037C 276 nt2.66□□□□□ -1.98
XBP1P40489 YPR053CYPR053C 456 nt2.66□□□□□ -1.98
XBP1P40489 DAD3YBR233W-A 285 nt2.66□□□□□ -1.98
XBP1P40489 snR49snR49 165 nt2.66□□□□□ -1.98
XBP1P40489 MDV1YJL112W 2145 nt2.66□□□□□ -1.98
XBP1P40489 TPS2YDR074W 2691 nt2.65□□□□□ -1.98
XBP1P40489 VBA4YDR119W 2307 nt2.65□□□□□ -1.98
XBP1P40489 SGO1YOR073W 1773 nt2.65□□□□□ -1.99
XBP1P40489 YDL062WYDL062W 426 nt2.65□□□□□ -1.99
XBP1P40489 CSN9YDR179C 489 nt2.65□□□□□ -1.99
XBP1P40489 YGR151CYGR151C 336 nt2.65□□□□□ -1.99
XBP1P40489 SDH2YLL041C 801 nt2.65□□□□□ -1.99
XBP1P40489 RPL20BYOR312C 519 nt2.65□□□□□ -1.99
XBP1P40489 YME2YMR302C 2553 nt2.65□□□□□ -1.99
XBP1P40489 CDH1YGL003C 1701 nt2.65□□□□□ -1.99
XBP1P40489 TOM70YNL121C 1854 nt2.65□□□□□ -1.99
XBP1P40489 STN1YDR082W 1485 nt2.65□□□□□ -1.99
XBP1P40489 PHO81YGR233C 3537 nt2.64□□□□□ -1.99
XBP1P40489 MYO5YMR109W 3660 nt2.64□□□□□ -1.99
XBP1P40489 NCE101YJL205C 162 nt2.64□□□□□ -1.99
XBP1P40489 GPI14YJR013W 1212 nt2.64□□□□□ -1.99
XBP1P40489 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.64□□□□□ -1.99
XBP1P40489 REG1YDR028C 3045 nt2.63□□□□□ -1.99
XBP1P40489 PDC2YDR081C 2778 nt2.63□□□□□ -1.99
XBP1P40489 EPL1YFL024C 2499 nt2.63□□□□□ -1.99
XBP1P40489 NAN1YPL126W 2691 nt2.63□□□□□ -1.99
XBP1P40489 YFH1YDL120W 525 nt2.63□□□□□ -1.99
XBP1P40489 MZM1YDR493W 372 nt2.63□□□□□ -1.99
XBP1P40489 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.63□□□□□ -1.99
XBP1P40489 YBL065WYBL065W 345 nt2.63□□□□□ -1.99
XBP1P40489 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.63□□□□□ -1.99
XBP1P40489 YPR014CYPR014C 330 nt2.63□□□□□ -1.99
XBP1P40489 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.63□□□□□ -1.99
XBP1P40489 FAR1YJL157C 2493 nt2.63□□□□□ -1.99
XBP1P40489 POL2YNL262W 6669 nt2.63□□□□□ -1.99
XBP1P40489 RRM3YHR031C 2172 nt2.63□□□□□ -1.99
XBP1P40489 VPS52YDR484W 1926 nt2.62□□□□□ -1.99
XBP1P40489 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt2.62□□□□□ -1.99
XBP1P40489 YRB1YDR002W 606 nt2.62□□□□□ -1.99
XBP1P40489 Q0143Q0143 153 nt2.62□□□□□ -1.99
XBP1P40489 ATP15YPL271W 189 nt2.62□□□□□ -1.99
XBP1P40489 HCS1YKL017C 2052 nt2.62□□□□□ -1.99
XBP1P40489 SSY1YDR160W 2559 nt2.61□□□□□ -1.99
XBP1P40489 XRN1YGL173C 4587 nt2.61□□□□□ -1.99
XBP1P40489 SMC2YFR031C 3513 nt2.61□□□□□ -1.99
XBP1P40489 YJL016WYJL016W 1686 nt2.61□□□□□ -1.99
XBP1P40489 YDL041WYDL041W 354 nt2.61□□□□□ -1.99
XBP1P40489 RPS24AYER074W 408 nt2.61□□□□□ -1.99
XBP1P40489 RPL23BYER117W 414 nt2.61□□□□□ -1.99
XBP1P40489 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.61□□□□□ -1.99
XBP1P40489 RPA34YJL148W 702 nt2.61□□□□□ -1.99
XBP1P40489 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt2.61□□□□□ -1.99
XBP1P40489 IES4YOR189W 351 nt2.61□□□□□ -1.99
XBP1P40489 MGR1YCL044C 1254 nt2.61□□□□□ -1.99
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