Protein–RNA interactions for Protein: P39548

YAR028W, DUP240 protein YAR028W, yeastyeast

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAR028WP39548 SPT10YJL127C 1923 nt3.36□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 RNR1YER070W 2667 nt3.36□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 SSE1YPL106C 2082 nt3.35□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 MVP1YMR004W 1536 nt3.35□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 YIL166CYIL166C 1629 nt3.35□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 FAP7YDL166C 594 nt3.35□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 BNA4YBL098W 1383 nt3.35□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 MYO3YKL129C 3819 nt3.35□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 ECM25YJL201W 1800 nt3.35□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 RIM20YOR275C 1986 nt3.34□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 VPS3YDR495C 3036 nt3.34□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 PHM6YDR281C 315 nt3.34□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 GPG1YGL121C 381 nt3.34□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 SPT4YGR063C 309 nt3.34□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 AYR1YIL124W 894 nt3.34□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 YLR053CYLR053C 327 nt3.34□□□□□ -1.87
YAR028WP39548 SMC3YJL074C 3693 nt3.33□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt3.33□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 RPL36AYMR194W 303 nt3.33□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 YOR302WYOR302W 78 nt3.33□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 TRS65YGR166W 1683 nt3.33□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 GPI13YLL031C 3054 nt3.32□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt3.32□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt3.32□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt3.32□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 YMR324CYMR324C 243 nt3.32□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 YBR197CYBR197C 654 nt3.32□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 SHQ1YIL104C 1524 nt3.32□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.32□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 SLA1YBL007C 3735 nt3.31□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 DIS3YOL021C 3006 nt3.31□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt3.31□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 RPL20BYOR312C 519 nt3.31□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt3.31□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 SOK2YMR016C 2358 nt3.31□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 PKH1YDR490C 2301 nt3.3□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 YGL052WYGL052W 306 nt3.3□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 RPS23AYGR118W 438 nt3.3□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.3□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 TMA19YKL056C 504 nt3.3□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 COX19YLL018C-A 297 nt3.3□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 SAR1YPL218W 573 nt3.3□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 PDR12YPL058C 4536 nt3.3□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 RRP5YMR229C 5190 nt3.3□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 MYO5YMR109W 3660 nt3.29□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 AUS1YOR011W 4185 nt3.29□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 GCD6YDR211W 2139 nt3.28□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 YDR193WYDR193W 399 nt3.28□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.28□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 PAU2YEL049W 363 nt3.28□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 YJL150WYJL150W 303 nt3.28□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 CYB5YNL111C 363 nt3.28□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 GIS2YNL255C 462 nt3.28□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 HHT1YBR010W 411 nt3.28□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 YPR063CYPR063C 423 nt3.28□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 SCW11YGL028C 1629 nt3.28□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 PRP22YER013W 3438 nt3.28□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 RAD4YER162C 2265 nt3.28□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 EXO84YBR102C 2262 nt3.28□□□□□ -1.88
YAR028WP39548 KEL2YGR238C 2649 nt3.27□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 QCR7YDR529C 384 nt3.27□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 YER088C-AYER088C-A 324 nt3.27□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 YFL065CYFL065C 309 nt3.27□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 YHL041WYHL041W 450 nt3.27□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 RAM2YKL019W 951 nt3.27□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 RLF2YPR018W 1821 nt3.27□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 NUP120YKL057C 3114 nt3.27□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 APC2YLR127C 2562 nt3.27□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 ZDS2YML109W 2829 nt3.27□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 BFA1YJR053W 1725 nt3.27□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 MET10YFR030W 3108 nt3.26□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 YEL025CYEL025C 3567 nt3.26□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 PUF6YDR496C 1971 nt3.26□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 PSF1YDR013W 627 nt3.26□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 HEF3YNL014W 3135 nt3.26□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 RPN2YIL075C 2838 nt3.26□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 KAP95YLR347C 2586 nt3.26□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 FAR1YJL157C 2493 nt3.26□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 DLS1YJL065C 504 nt3.25□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 RPS27AYKL156W 249 nt3.25□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt3.25□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 MRPL33YMR286W 261 nt3.25□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 MIT1YEL007W 2001 nt3.25□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 VTC4YJL012C 2166 nt3.25□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 PSO2YMR137C 1986 nt3.25□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt3.24□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt3.24□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt3.24□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt3.24□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt3.24□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 YCL019WYCL019W 5313 nt3.24□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 GCN1YGL195W 8019 nt3.24□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 STU2YLR045C 2667 nt3.24□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 SYT1YPR095C 3681 nt3.24□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 RBK1YCR036W 1002 nt3.24□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 snR60snR60 104 nt3.24□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 LSO2YGR169C-A 279 nt3.24□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 PHS1YJL097W 654 nt3.24□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 YNL010WYNL010W 726 nt3.24□□□□□ -1.89
YAR028WP39548 BOI1YBL085W 2943 nt3.24□□□□□ -1.89
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