Protein–RNA interactions for Protein: P38999

LYS9, Saccharopine dehydrogenase [NADP(+), L-glutamate-forming], yeast

Predictions only

Length 446 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LYS9	P38999	RPL8B	YLL045C	771 nt		3.01	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	YLR031W	YLR031W	561 nt		3.01	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	YMR290W-A	YMR290W-A	348 nt		3.01	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	PGA1	YNL158W	597 nt		3.01	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	COG3	YER157W	2406 nt		3	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	ILS1	YBL076C	3219 nt		3	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	RPS17B	YDR447C	411 nt		3	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	YIL058W	YIL058W	285 nt		3	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	PAU14	YIL176C	363 nt		3	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	PAU1	YJL223C	363 nt		3	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	RPS22B	YLR367W	393 nt		3	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	RPL20B	YOR312C	519 nt		3	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	YPR010C-A	YPR010C-A	219 nt		3	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	GIS4	YML006C	2325 nt		2.99	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	TPS2	YDR074W	2691 nt		2.99	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	MSS11	YMR164C	2277 nt		2.99	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	COA4	YLR218C	453 nt		2.99	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	COX7	YMR256C	183 nt		2.99	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	PCF11	YDR228C	1881 nt		2.99	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	FUS1	YCL027W	1539 nt		2.98	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	RRM3	YHR031C	2172 nt		2.98	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	PMR1	YGL167C	2853 nt		2.98	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	SPG3	YDR504C	384 nt		2.98	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	YFR056C	YFR056C	369 nt		2.98	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	YKL033W-A	YKL033W-A	711 nt		2.98	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	BOI1	YBL085W	2943 nt		2.98	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	DSE4	YNR067C	3354 nt		2.98	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	YBP1	YBR216C	2025 nt		2.97	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	NET1	YJL076W	3570 nt		2.97	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	YDR183C-A	YDR183C-A	258 nt		2.97	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	GCD6	YDR211W	2139 nt		2.97	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	GCN4	YEL009C	846 nt		2.97	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	HPA3	YEL066W	540 nt		2.97	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	YPL229W	YPL229W	621 nt		2.97	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	VPS41	YDR080W	2979 nt		2.97	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	YPK1	YKL126W	2043 nt		2.97	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	NAN1	YPL126W	2691 nt		2.96	□□□□□ -1.93
LYS9	P38999	NOT5	YPR072W	1683 nt		2.96	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	FCF2	YLR051C	654 nt		2.96	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	COX14	YML129C	213 nt		2.96	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	YBL073W	YBL073W	312 nt		2.96	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	RPL33A	YPL143W	324 nt		2.96	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	YHR078W	YHR078W	1659 nt		2.95	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	DYN1	YKR054C	12279 nt		2.95	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	ADK1	YDR226W	669 nt		2.95	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	REV1	YOR346W	2958 nt		2.95	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	ITC1	YGL133W	3795 nt		2.95	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	SKP2	YNL311C	2292 nt		2.95	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	JIP5	YPR169W	1479 nt		2.95	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	FUN30	YAL019W	3396 nt		2.95	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	TCB2	YNL087W	3537 nt		2.94	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	AST2	YER101C	1293 nt		2.94	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	NUP82	YJL061W	2142 nt		2.94	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	PHD1	YKL043W	1101 nt		2.94	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	LCL2	YLR104W	396 nt		2.94	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	ISF1	YMR081C	1017 nt		2.94	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	SPB1	YCL054W	2526 nt		2.94	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	PUF6	YDR496C	1971 nt		2.94	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	TAO3	YIL129C	7131 nt		2.93	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	VPS52	YDR484W	1926 nt		2.93	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	BRO1	YPL084W	2535 nt		2.93	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	DYN2	YDR424C	279 nt		2.93	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	YER023C-A	YER023C-A	213 nt		2.93	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	YMR31	YFR049W	372 nt		2.93	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	ERP6	YGL002W	651 nt		2.93	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	NCE101	YJL205C	162 nt		2.93	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	TSC11	YER093C	4293 nt		2.93	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	POM152	YMR129W	4014 nt		2.93	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	PSK2	YOL045W	3306 nt		2.93	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	ORC1	YML065W	2745 nt		2.92	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	PSY2	YNL201C	2577 nt		2.92	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	BNA4	YBL098W	1383 nt		2.92	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	RLF2	YPR018W	1821 nt		2.92	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	YDR169C-A	YDR169C-A	150 nt		2.92	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	RPL26A	YLR344W	384 nt		2.92	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	RPS12	YOR369C	432 nt		2.92	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	ATP15	YPL271W	189 nt		2.92	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	RGR1	YLR071C	3249 nt		2.91	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	YDL011C	YDL011C	324 nt		2.91	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	YDL041W	YDL041W	354 nt		2.91	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	YGR174W-A	YGR174W-A	87 nt		2.91	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	HYR1	YIR037W	492 nt		2.91	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	PSY1	YKL076C	384 nt		2.91	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	BPT1	YLL015W	4680 nt		2.91	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	YNL337W	YNL337W	255 nt		2.91	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	YBR085C-A	YBR085C-A	258 nt		2.91	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	YOL057W	YOL057W	2136 nt		2.9	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	YIL082W-A	YIL082W-A	4497 nt		2.9	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	YIL166C	YIL166C	1629 nt		2.9	□□□□□ -1.94
LYS9	P38999	DAD4	YDR320C-A	219 nt		2.9	□□□□□ -1.95
LYS9	P38999	YFL063W	YFL063W	456 nt		2.9	□□□□□ -1.95
LYS9	P38999	tM(CAU)Q1	tM(CAU)Q1	76 nt		2.9	□□□□□ -1.95
LYS9	P38999	YHR007C-A	YHR007C-A	216 nt		2.9	□□□□□ -1.95
LYS9	P38999	YJL015C	YJL015C	285 nt		2.9	□□□□□ -1.95
LYS9	P38999	TMA22	YJR014W	597 nt		2.9	□□□□□ -1.95
LYS9	P38999	YKL183C-A	YKL183C-A	213 nt		2.9	□□□□□ -1.95
LYS9	P38999	YKR033C	YKR033C	426 nt		2.9	□□□□□ -1.95
LYS9	P38999	UTP30	YKR060W	825 nt		2.9	□□□□□ -1.95
LYS9	P38999	RPS18B	YML026C	441 nt		2.9	□□□□□ -1.95
LYS9	P38999	GYP7	YDL234C	2241 nt		2.9	□□□□□ -1.95

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.6 ms