Protein–RNA interactions for Protein: P38871

SSP1, Sporulation-specific protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSP1P38871 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt5.11□□□□□ -1.59
SSP1P38871 FEX2YPL279C 1128 nt5.11□□□□□ -1.59
SSP1P38871 GCN20YFR009W 2259 nt5.11□□□□□ -1.59
SSP1P38871 SPT21YMR179W 2277 nt5.11□□□□□ -1.59
SSP1P38871 PDR10YOR328W 4695 nt5.1□□□□□ -1.59
SSP1P38871 FOX2YKR009C 2703 nt5.1□□□□□ -1.59
SSP1P38871 ALK2YBL009W 2031 nt5.1□□□□□ -1.59
SSP1P38871 COX14YML129C 213 nt5.1□□□□□ -1.59
SSP1P38871 APL4YPR029C 2499 nt5.1□□□□□ -1.59
SSP1P38871 CCM1YGR150C 2595 nt5.1□□□□□ -1.59
SSP1P38871 YMR31YFR049W 372 nt5.09□□□□□ -1.59
SSP1P38871 MIM2YLR099W-A 264 nt5.09□□□□□ -1.59
SSP1P38871 DOT6YER088C 2013 nt5.09□□□□□ -1.6
SSP1P38871 RAM2YKL019W 951 nt5.08□□□□□ -1.6
SSP1P38871 YML116W-AYML116W-A 303 nt5.08□□□□□ -1.6
SSP1P38871 HOT1YMR172W 2160 nt5.08□□□□□ -1.6
SSP1P38871 DUF1YOL087C 3351 nt5.07□□□□□ -1.6
SSP1P38871 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt5.07□□□□□ -1.6
SSP1P38871 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt5.07□□□□□ -1.6
SSP1P38871 AXL2YIL140W 2472 nt5.07□□□□□ -1.6
SSP1P38871 IPT1YDR072C 1584 nt5.07□□□□□ -1.6
SSP1P38871 YLR352WYLR352W 2424 nt5.06□□□□□ -1.6
SSP1P38871 GUP1YGL084C 1683 nt5.06□□□□□ -1.6
SSP1P38871 YHL005CYHL005C 393 nt5.06□□□□□ -1.6
SSP1P38871 GIS2YNL255C 462 nt5.06□□□□□ -1.6
SSP1P38871 SPB1YCL054W 2526 nt5.06□□□□□ -1.6
SSP1P38871 DIP2YLR129W 2832 nt5.06□□□□□ -1.6
SSP1P38871 ABP140YOR239W 1887 nt5.05□□□□□ -1.6
SSP1P38871 TOP1YOL006C 2310 nt5.05□□□□□ -1.6
SSP1P38871 CFT2YLR115W 2580 nt5.05□□□□□ -1.6
SSP1P38871 ECM12YHR021W-A 456 nt5.05□□□□□ -1.6
SSP1P38871 HSC82YMR186W 2118 nt5.05□□□□□ -1.6
SSP1P38871 YOR333CYOR333C 417 nt5.04□□□□□ -1.6
SSP1P38871 PAN1YIR006C 4443 nt5.04□□□□□ -1.6
SSP1P38871 PLC1YPL268W 2610 nt5.04□□□□□ -1.6
SSP1P38871 RNR1YER070W 2667 nt5.02□□□□□ -1.61
SSP1P38871 MDR1YGR100W 2853 nt5.02□□□□□ -1.61
SSP1P38871 PMP1YCR024C-A 123 nt5.02□□□□□ -1.61
SSP1P38871 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt5.02□□□□□ -1.61
SSP1P38871 SBH1YER087C-B 249 nt5.02□□□□□ -1.61
SSP1P38871 REG1YDR028C 3045 nt5.02□□□□□ -1.61
SSP1P38871 MGR2YPL098C 342 nt5.01□□□□□ -1.61
SSP1P38871 POM152YMR129W 4014 nt5.01□□□□□ -1.61
SSP1P38871 YEL043WYEL043W 2871 nt5.01□□□□□ -1.61
SSP1P38871 EXO84YBR102C 2262 nt5□□□□□ -1.61
SSP1P38871 USE1YGL098W 738 nt5□□□□□ -1.61
SSP1P38871 MRPL39YML009C 213 nt5□□□□□ -1.61
SSP1P38871 RPS17AYML024W 411 nt5□□□□□ -1.61
SSP1P38871 USA1YML029W 2517 nt5□□□□□ -1.61
SSP1P38871 CAF4YKR036C 1932 nt4.99□□□□□ -1.61
SSP1P38871 PAN3YKL025C 2040 nt4.99□□□□□ -1.61
SSP1P38871 HEH2YDR458C 1992 nt4.99□□□□□ -1.61
SSP1P38871 RPL33BYOR234C 324 nt4.99□□□□□ -1.61
SSP1P38871 MTR10YOR160W 2919 nt4.99□□□□□ -1.61
SSP1P38871 JEN1YKL217W 1851 nt4.98□□□□□ -1.61
SSP1P38871 BRE4YDL231C 3378 nt4.98□□□□□ -1.61
SSP1P38871 PIG1YLR273C 1947 nt4.98□□□□□ -1.61
SSP1P38871 BAS1YKR099W 2436 nt4.97□□□□□ -1.61
SSP1P38871 VMA1YDL185W 3216 nt4.97□□□□□ -1.61
SSP1P38871 CRT10YOL063C 2874 nt4.97□□□□□ -1.61
SSP1P38871 NOP53YPL146C 1368 nt4.97□□□□□ -1.61
SSP1P38871 YIL165CYIL165C 360 nt4.97□□□□□ -1.61
SSP1P38871 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt4.97□□□□□ -1.61
SSP1P38871 FLO10YKR102W 3510 nt4.97□□□□□ -1.61
SSP1P38871 SEC15YGL233W 2733 nt4.97□□□□□ -1.61
SSP1P38871 TMA108YIL137C 2841 nt4.96□□□□□ -1.61
SSP1P38871 PSO2YMR137C 1986 nt4.96□□□□□ -1.62
SSP1P38871 EFR3YMR212C 2349 nt4.96□□□□□ -1.62
SSP1P38871 KAR2YJL034W 2049 nt4.96□□□□□ -1.62
SSP1P38871 SOK1YDR006C 2706 nt4.95□□□□□ -1.62
SSP1P38871 VBA4YDR119W 2307 nt4.95□□□□□ -1.62
SSP1P38871 RIA1YNL163C 3333 nt4.95□□□□□ -1.62
SSP1P38871 VID22YLR373C 2706 nt4.95□□□□□ -1.62
SSP1P38871 VMA9YCL005W-A 222 nt4.95□□□□□ -1.62
SSP1P38871 MET10YFR030W 3108 nt4.94□□□□□ -1.62
SSP1P38871 YBL065WYBL065W 345 nt4.94□□□□□ -1.62
SSP1P38871 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt4.94□□□□□ -1.62
SSP1P38871 MCD4YKL165C 2760 nt4.94□□□□□ -1.62
SSP1P38871 MNN4YKL201C 3537 nt4.94□□□□□ -1.62
SSP1P38871 TCO89YPL180W 2400 nt4.94□□□□□ -1.62
SSP1P38871 BCH1YMR237W 2175 nt4.94□□□□□ -1.62
SSP1P38871 RLI1YDR091C 1827 nt4.93□□□□□ -1.62
SSP1P38871 SGD1YLR336C 2700 nt4.93□□□□□ -1.62
SSP1P38871 SEG1YMR086W 2883 nt4.93□□□□□ -1.62
SSP1P38871 YJL022WYJL022W 309 nt4.93□□□□□ -1.62
SSP1P38871 FAR1YJL157C 2493 nt4.93□□□□□ -1.62
SSP1P38871 YOR218CYOR218C 420 nt4.93□□□□□ -1.62
SSP1P38871 LYS2YBR115C 4179 nt4.93□□□□□ -1.62
SSP1P38871 HOS3YPL116W 2094 nt4.93□□□□□ -1.62
SSP1P38871 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt4.93□□□□□ -1.62
SSP1P38871 YJL070CYJL070C 2667 nt4.92□□□□□ -1.62
SSP1P38871 ASG1YIL130W 2895 nt4.92□□□□□ -1.62
SSP1P38871 PRP22YER013W 3438 nt4.92□□□□□ -1.62
SSP1P38871 PMP2YEL017C-A 132 nt4.92□□□□□ -1.62
SSP1P38871 BRP1YGL007W 378 nt4.92□□□□□ -1.62
SSP1P38871 YIR044CYIR044C 186 nt4.92□□□□□ -1.62
SSP1P38871 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt4.91□□□□□ -1.62
SSP1P38871 EMC1YCL045C 2283 nt4.91□□□□□ -1.62
SSP1P38871 RTC6YPL183W-A 282 nt4.9□□□□□ -1.63
SSP1P38871 VPS3YDR495C 3036 nt4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.1 ms