Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms