Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z309

Cib2, Calcium and integrin-binding family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib2Q9Z309 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cib2Q9Z309 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cib2Q9Z309 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cib2Q9Z309 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cib2Q9Z309 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cib2Q9Z309 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cib2Q9Z309 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cib2Q9Z309 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cib2Q9Z309 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cib2Q9Z309 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cib2Q9Z309 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cib2Q9Z309 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cib2Q9Z309 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cib2Q9Z309 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cib2Q9Z309 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cib2Q9Z309 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cib2Q9Z309 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cib2Q9Z309 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cib2Q9Z309 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cib2Q9Z309 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cib2Q9Z309 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cib2Q9Z309 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cib2Q9Z309 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cib2Q9Z309 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cib2Q9Z309 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cib2Q9Z309 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cib2Q9Z309 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cib2Q9Z309 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cib2Q9Z309 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cib2Q9Z309 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cib2Q9Z309 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cib2Q9Z309 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cib2Q9Z309 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cib2Q9Z309 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cib2Q9Z309 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cib2Q9Z309 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cib2Q9Z309 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cib2Q9Z309 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cib2Q9Z309 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cib2Q9Z309 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cib2Q9Z309 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cib2Q9Z309 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cib2Q9Z309 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cib2Q9Z309 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cib2Q9Z309 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cib2Q9Z309 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cib2Q9Z309 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cib2Q9Z309 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cib2Q9Z309 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cib2Q9Z309 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cib2Q9Z309 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cib2Q9Z309 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cib2Q9Z309 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cib2Q9Z309 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cib2Q9Z309 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cib2Q9Z309 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cib2Q9Z309 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cib2Q9Z309 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cib2Q9Z309 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cib2Q9Z309 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cib2Q9Z309 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cib2Q9Z309 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cib2Q9Z309 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cib2Q9Z309 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cib2Q9Z309 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cib2Q9Z309 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cib2Q9Z309 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cib2Q9Z309 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cib2Q9Z309 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cib2Q9Z309 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cib2Q9Z309 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cib2Q9Z309 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cib2Q9Z309 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cib2Q9Z309 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cib2Q9Z309 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cib2Q9Z309 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cib2Q9Z309 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cib2Q9Z309 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cib2Q9Z309 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cib2Q9Z309 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cib2Q9Z309 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cib2Q9Z309 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cib2Q9Z309 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cib2Q9Z309 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cib2Q9Z309 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cib2Q9Z309 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cib2Q9Z309 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cib2Q9Z309 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cib2Q9Z309 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cib2Q9Z309 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cib2Q9Z309 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cib2Q9Z309 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cib2Q9Z309 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cib2Q9Z309 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cib2Q9Z309 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cib2Q9Z309 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cib2Q9Z309 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cib2Q9Z309 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cib2Q9Z309 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cib2Q9Z309 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms