Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V4

Pck1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pck1Q9Z2V4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pck1Q9Z2V4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pck1Q9Z2V4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pck1Q9Z2V4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pck1Q9Z2V4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pck1Q9Z2V4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pck1Q9Z2V4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pck1Q9Z2V4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Pck1Q9Z2V4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pck1Q9Z2V4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pck1Q9Z2V4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pck1Q9Z2V4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pck1Q9Z2V4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pck1Q9Z2V4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pck1Q9Z2V4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pck1Q9Z2V4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pck1Q9Z2V4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pck1Q9Z2V4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pck1Q9Z2V4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pck1Q9Z2V4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pck1Q9Z2V4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pck1Q9Z2V4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pck1Q9Z2V4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pck1Q9Z2V4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pck1Q9Z2V4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pck1Q9Z2V4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Pck1Q9Z2V4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pck1Q9Z2V4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Pck1Q9Z2V4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pck1Q9Z2V4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pck1Q9Z2V4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pck1Q9Z2V4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pck1Q9Z2V4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pck1Q9Z2V4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pck1Q9Z2V4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pck1Q9Z2V4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pck1Q9Z2V4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pck1Q9Z2V4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pck1Q9Z2V4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pck1Q9Z2V4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pck1Q9Z2V4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pck1Q9Z2V4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pck1Q9Z2V4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pck1Q9Z2V4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pck1Q9Z2V4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pck1Q9Z2V4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pck1Q9Z2V4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pck1Q9Z2V4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pck1Q9Z2V4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pck1Q9Z2V4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pck1Q9Z2V4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pck1Q9Z2V4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pck1Q9Z2V4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pck1Q9Z2V4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pck1Q9Z2V4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pck1Q9Z2V4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pck1Q9Z2V4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pck1Q9Z2V4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pck1Q9Z2V4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pck1Q9Z2V4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pck1Q9Z2V4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pck1Q9Z2V4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pck1Q9Z2V4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pck1Q9Z2V4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pck1Q9Z2V4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pck1Q9Z2V4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pck1Q9Z2V4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pck1Q9Z2V4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pck1Q9Z2V4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pck1Q9Z2V4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pck1Q9Z2V4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pck1Q9Z2V4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pck1Q9Z2V4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pck1Q9Z2V4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pck1Q9Z2V4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pck1Q9Z2V4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pck1Q9Z2V4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pck1Q9Z2V4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pck1Q9Z2V4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pck1Q9Z2V4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pck1Q9Z2V4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pck1Q9Z2V4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pck1Q9Z2V4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pck1Q9Z2V4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pck1Q9Z2V4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pck1Q9Z2V4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pck1Q9Z2V4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pck1Q9Z2V4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pck1Q9Z2V4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pck1Q9Z2V4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pck1Q9Z2V4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pck1Q9Z2V4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pck1Q9Z2V4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pck1Q9Z2V4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pck1Q9Z2V4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pck1Q9Z2V4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pck1Q9Z2V4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pck1Q9Z2V4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pck1Q9Z2V4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pck1Q9Z2V4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 493.5 ms