Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp5Q9Z2P8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp5Q9Z2P8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp5Q9Z2P8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp5Q9Z2P8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp5Q9Z2P8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp5Q9Z2P8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp5Q9Z2P8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp5Q9Z2P8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp5Q9Z2P8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp5Q9Z2P8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vamp5Q9Z2P8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp5Q9Z2P8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp5Q9Z2P8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp5Q9Z2P8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp5Q9Z2P8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp5Q9Z2P8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp5Q9Z2P8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp5Q9Z2P8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp5Q9Z2P8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp5Q9Z2P8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp5Q9Z2P8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp5Q9Z2P8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp5Q9Z2P8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp5Q9Z2P8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp5Q9Z2P8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp5Q9Z2P8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp5Q9Z2P8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp5Q9Z2P8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp5Q9Z2P8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp5Q9Z2P8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vamp5Q9Z2P8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vamp5Q9Z2P8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp5Q9Z2P8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp5Q9Z2P8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp5Q9Z2P8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp5Q9Z2P8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp5Q9Z2P8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp5Q9Z2P8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp5Q9Z2P8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp5Q9Z2P8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp5Q9Z2P8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp5Q9Z2P8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp5Q9Z2P8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp5Q9Z2P8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp5Q9Z2P8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp5Q9Z2P8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp5Q9Z2P8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp5Q9Z2P8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp5Q9Z2P8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp5Q9Z2P8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp5Q9Z2P8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp5Q9Z2P8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp5Q9Z2P8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp5Q9Z2P8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp5Q9Z2P8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp5Q9Z2P8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp5Q9Z2P8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp5Q9Z2P8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp5Q9Z2P8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp5Q9Z2P8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp5Q9Z2P8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp5Q9Z2P8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp5Q9Z2P8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp5Q9Z2P8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms