Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubl3Q9Z2M6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubl3Q9Z2M6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubl3Q9Z2M6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubl3Q9Z2M6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubl3Q9Z2M6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubl3Q9Z2M6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubl3Q9Z2M6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubl3Q9Z2M6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubl3Q9Z2M6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubl3Q9Z2M6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubl3Q9Z2M6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubl3Q9Z2M6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubl3Q9Z2M6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubl3Q9Z2M6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubl3Q9Z2M6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubl3Q9Z2M6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubl3Q9Z2M6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubl3Q9Z2M6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubl3Q9Z2M6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubl3Q9Z2M6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubl3Q9Z2M6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubl3Q9Z2M6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubl3Q9Z2M6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubl3Q9Z2M6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubl3Q9Z2M6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubl3Q9Z2M6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubl3Q9Z2M6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubl3Q9Z2M6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubl3Q9Z2M6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubl3Q9Z2M6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubl3Q9Z2M6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubl3Q9Z2M6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubl3Q9Z2M6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubl3Q9Z2M6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubl3Q9Z2M6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubl3Q9Z2M6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubl3Q9Z2M6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubl3Q9Z2M6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubl3Q9Z2M6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubl3Q9Z2M6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubl3Q9Z2M6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubl3Q9Z2M6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubl3Q9Z2M6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubl3Q9Z2M6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubl3Q9Z2M6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubl3Q9Z2M6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubl3Q9Z2M6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubl3Q9Z2M6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubl3Q9Z2M6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubl3Q9Z2M6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubl3Q9Z2M6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubl3Q9Z2M6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubl3Q9Z2M6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubl3Q9Z2M6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubl3Q9Z2M6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubl3Q9Z2M6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubl3Q9Z2M6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubl3Q9Z2M6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubl3Q9Z2M6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubl3Q9Z2M6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubl3Q9Z2M6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubl3Q9Z2M6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubl3Q9Z2M6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubl3Q9Z2M6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubl3Q9Z2M6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubl3Q9Z2M6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubl3Q9Z2M6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubl3Q9Z2M6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubl3Q9Z2M6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubl3Q9Z2M6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ubl3Q9Z2M6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ubl3Q9Z2M6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubl3Q9Z2M6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubl3Q9Z2M6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubl3Q9Z2M6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubl3Q9Z2M6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubl3Q9Z2M6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubl3Q9Z2M6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubl3Q9Z2M6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubl3Q9Z2M6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubl3Q9Z2M6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubl3Q9Z2M6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubl3Q9Z2M6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubl3Q9Z2M6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubl3Q9Z2M6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubl3Q9Z2M6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubl3Q9Z2M6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubl3Q9Z2M6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubl3Q9Z2M6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubl3Q9Z2M6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubl3Q9Z2M6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubl3Q9Z2M6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubl3Q9Z2M6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubl3Q9Z2M6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubl3Q9Z2M6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubl3Q9Z2M6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubl3Q9Z2M6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms