Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H7

Gipc2, PDZ domain-containing protein GIPC2, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc2Q9Z2H7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gipc2Q9Z2H7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gipc2Q9Z2H7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gipc2Q9Z2H7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gipc2Q9Z2H7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gipc2Q9Z2H7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gipc2Q9Z2H7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gipc2Q9Z2H7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gipc2Q9Z2H7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gipc2Q9Z2H7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gipc2Q9Z2H7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gipc2Q9Z2H7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gipc2Q9Z2H7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gipc2Q9Z2H7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gipc2Q9Z2H7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gipc2Q9Z2H7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gipc2Q9Z2H7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gipc2Q9Z2H7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gipc2Q9Z2H7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gipc2Q9Z2H7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gipc2Q9Z2H7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gipc2Q9Z2H7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gipc2Q9Z2H7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gipc2Q9Z2H7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gipc2Q9Z2H7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gipc2Q9Z2H7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gipc2Q9Z2H7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gipc2Q9Z2H7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gipc2Q9Z2H7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gipc2Q9Z2H7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gipc2Q9Z2H7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gipc2Q9Z2H7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gipc2Q9Z2H7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms