Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ilf3Q9Z1X4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ilf3Q9Z1X4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ilf3Q9Z1X4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ilf3Q9Z1X4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ilf3Q9Z1X4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ilf3Q9Z1X4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ilf3Q9Z1X4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ilf3Q9Z1X4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ilf3Q9Z1X4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ilf3Q9Z1X4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ilf3Q9Z1X4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ilf3Q9Z1X4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ilf3Q9Z1X4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ilf3Q9Z1X4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ilf3Q9Z1X4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ilf3Q9Z1X4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ilf3Q9Z1X4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ilf3Q9Z1X4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ilf3Q9Z1X4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ilf3Q9Z1X4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ilf3Q9Z1X4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ilf3Q9Z1X4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ilf3Q9Z1X4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ilf3Q9Z1X4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ilf3Q9Z1X4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ilf3Q9Z1X4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ilf3Q9Z1X4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ilf3Q9Z1X4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ilf3Q9Z1X4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ilf3Q9Z1X4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ilf3Q9Z1X4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ilf3Q9Z1X4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ilf3Q9Z1X4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ilf3Q9Z1X4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ilf3Q9Z1X4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ilf3Q9Z1X4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ilf3Q9Z1X4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ilf3Q9Z1X4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ilf3Q9Z1X4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ilf3Q9Z1X4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ilf3Q9Z1X4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ilf3Q9Z1X4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ilf3Q9Z1X4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ilf3Q9Z1X4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ilf3Q9Z1X4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ilf3Q9Z1X4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ilf3Q9Z1X4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ilf3Q9Z1X4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ilf3Q9Z1X4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ilf3Q9Z1X4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ilf3Q9Z1X4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ilf3Q9Z1X4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ilf3Q9Z1X4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ilf3Q9Z1X4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ilf3Q9Z1X4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ilf3Q9Z1X4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ilf3Q9Z1X4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ilf3Q9Z1X4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ilf3Q9Z1X4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ilf3Q9Z1X4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ilf3Q9Z1X4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ilf3Q9Z1X4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ilf3Q9Z1X4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ilf3Q9Z1X4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ilf3Q9Z1X4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ilf3Q9Z1X4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ilf3Q9Z1X4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ilf3Q9Z1X4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ilf3Q9Z1X4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ilf3Q9Z1X4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ilf3Q9Z1X4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ilf3Q9Z1X4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ilf3Q9Z1X4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ilf3Q9Z1X4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ilf3Q9Z1X4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ilf3Q9Z1X4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ilf3Q9Z1X4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ilf3Q9Z1X4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ilf3Q9Z1X4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ilf3Q9Z1X4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ilf3Q9Z1X4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ilf3Q9Z1X4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ilf3Q9Z1X4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ilf3Q9Z1X4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ilf3Q9Z1X4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ilf3Q9Z1X4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ilf3Q9Z1X4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ilf3Q9Z1X4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ilf3Q9Z1X4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ilf3Q9Z1X4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ilf3Q9Z1X4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ilf3Q9Z1X4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ilf3Q9Z1X4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ilf3Q9Z1X4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ilf3Q9Z1X4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ilf3Q9Z1X4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ilf3Q9Z1X4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ilf3Q9Z1X4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ilf3Q9Z1X4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms