Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1K7

Apc2, Adenomatous polyposis coli protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apc2Q9Z1K7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apc2Q9Z1K7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Apc2Q9Z1K7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apc2Q9Z1K7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apc2Q9Z1K7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Apc2Q9Z1K7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apc2Q9Z1K7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apc2Q9Z1K7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apc2Q9Z1K7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apc2Q9Z1K7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apc2Q9Z1K7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apc2Q9Z1K7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apc2Q9Z1K7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apc2Q9Z1K7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apc2Q9Z1K7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apc2Q9Z1K7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Apc2Q9Z1K7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apc2Q9Z1K7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apc2Q9Z1K7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apc2Q9Z1K7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apc2Q9Z1K7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apc2Q9Z1K7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apc2Q9Z1K7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apc2Q9Z1K7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apc2Q9Z1K7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apc2Q9Z1K7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Apc2Q9Z1K7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apc2Q9Z1K7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apc2Q9Z1K7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apc2Q9Z1K7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apc2Q9Z1K7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apc2Q9Z1K7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apc2Q9Z1K7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apc2Q9Z1K7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apc2Q9Z1K7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apc2Q9Z1K7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apc2Q9Z1K7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apc2Q9Z1K7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apc2Q9Z1K7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apc2Q9Z1K7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apc2Q9Z1K7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Apc2Q9Z1K7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apc2Q9Z1K7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apc2Q9Z1K7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apc2Q9Z1K7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apc2Q9Z1K7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apc2Q9Z1K7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apc2Q9Z1K7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apc2Q9Z1K7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apc2Q9Z1K7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apc2Q9Z1K7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apc2Q9Z1K7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apc2Q9Z1K7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apc2Q9Z1K7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apc2Q9Z1K7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apc2Q9Z1K7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apc2Q9Z1K7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apc2Q9Z1K7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apc2Q9Z1K7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apc2Q9Z1K7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apc2Q9Z1K7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apc2Q9Z1K7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apc2Q9Z1K7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apc2Q9Z1K7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apc2Q9Z1K7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apc2Q9Z1K7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apc2Q9Z1K7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apc2Q9Z1K7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apc2Q9Z1K7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Apc2Q9Z1K7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apc2Q9Z1K7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apc2Q9Z1K7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apc2Q9Z1K7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Apc2Q9Z1K7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apc2Q9Z1K7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apc2Q9Z1K7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apc2Q9Z1K7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apc2Q9Z1K7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apc2Q9Z1K7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apc2Q9Z1K7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apc2Q9Z1K7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apc2Q9Z1K7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apc2Q9Z1K7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apc2Q9Z1K7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Apc2Q9Z1K7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apc2Q9Z1K7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apc2Q9Z1K7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apc2Q9Z1K7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apc2Q9Z1K7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apc2Q9Z1K7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apc2Q9Z1K7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apc2Q9Z1K7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apc2Q9Z1K7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Apc2Q9Z1K7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Apc2Q9Z1K7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Apc2Q9Z1K7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apc2Q9Z1K7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apc2Q9Z1K7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apc2Q9Z1K7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apc2Q9Z1K7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms