Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sumo3Q9Z172 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sumo3Q9Z172 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sumo3Q9Z172 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sumo3Q9Z172 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sumo3Q9Z172 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sumo3Q9Z172 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sumo3Q9Z172 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sumo3Q9Z172 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sumo3Q9Z172 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sumo3Q9Z172 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sumo3Q9Z172 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sumo3Q9Z172 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sumo3Q9Z172 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sumo3Q9Z172 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sumo3Q9Z172 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sumo3Q9Z172 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sumo3Q9Z172 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sumo3Q9Z172 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sumo3Q9Z172 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sumo3Q9Z172 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sumo3Q9Z172 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sumo3Q9Z172 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sumo3Q9Z172 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sumo3Q9Z172 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sumo3Q9Z172 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sumo3Q9Z172 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sumo3Q9Z172 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sumo3Q9Z172 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sumo3Q9Z172 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sumo3Q9Z172 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sumo3Q9Z172 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sumo3Q9Z172 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sumo3Q9Z172 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sumo3Q9Z172 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sumo3Q9Z172 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sumo3Q9Z172 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sumo3Q9Z172 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sumo3Q9Z172 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sumo3Q9Z172 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sumo3Q9Z172 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sumo3Q9Z172 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sumo3Q9Z172 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sumo3Q9Z172 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sumo3Q9Z172 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sumo3Q9Z172 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sumo3Q9Z172 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sumo3Q9Z172 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sumo3Q9Z172 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sumo3Q9Z172 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sumo3Q9Z172 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sumo3Q9Z172 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sumo3Q9Z172 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sumo3Q9Z172 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sumo3Q9Z172 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sumo3Q9Z172 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sumo3Q9Z172 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sumo3Q9Z172 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sumo3Q9Z172 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sumo3Q9Z172 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sumo3Q9Z172 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sumo3Q9Z172 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sumo3Q9Z172 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sumo3Q9Z172 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sumo3Q9Z172 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sumo3Q9Z172 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sumo3Q9Z172 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sumo3Q9Z172 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sumo3Q9Z172 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sumo3Q9Z172 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sumo3Q9Z172 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sumo3Q9Z172 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sumo3Q9Z172 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sumo3Q9Z172 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sumo3Q9Z172 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sumo3Q9Z172 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sumo3Q9Z172 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sumo3Q9Z172 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sumo3Q9Z172 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sumo3Q9Z172 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sumo3Q9Z172 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sumo3Q9Z172 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sumo3Q9Z172 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sumo3Q9Z172 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sumo3Q9Z172 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sumo3Q9Z172 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sumo3Q9Z172 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sumo3Q9Z172 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sumo3Q9Z172 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Sumo3Q9Z172 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sumo3Q9Z172 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Sumo3Q9Z172 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sumo3Q9Z172 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sumo3Q9Z172 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sumo3Q9Z172 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sumo3Q9Z172 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sumo3Q9Z172 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sumo3Q9Z172 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sumo3Q9Z172 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sumo3Q9Z172 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.3 ms