Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPN6Q9Y6Q1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPN6Q9Y6Q1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPN6Q9Y6Q1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPN6Q9Y6Q1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPN6Q9Y6Q1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPN6Q9Y6Q1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPN6Q9Y6Q1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPN6Q9Y6Q1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN6Q9Y6Q1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN6Q9Y6Q1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPN6Q9Y6Q1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPN6Q9Y6Q1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAPN6Q9Y6Q1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPN6Q9Y6Q1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPN6Q9Y6Q1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPN6Q9Y6Q1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAPN6Q9Y6Q1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAPN6Q9Y6Q1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAPN6Q9Y6Q1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPN6Q9Y6Q1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPN6Q9Y6Q1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPN6Q9Y6Q1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPN6Q9Y6Q1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPN6Q9Y6Q1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPN6Q9Y6Q1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN6Q9Y6Q1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN6Q9Y6Q1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN6Q9Y6Q1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN6Q9Y6Q1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN6Q9Y6Q1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPN6Q9Y6Q1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPN6Q9Y6Q1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN6Q9Y6Q1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPN6Q9Y6Q1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPN6Q9Y6Q1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPN6Q9Y6Q1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPN6Q9Y6Q1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPN6Q9Y6Q1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPN6Q9Y6Q1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPN6Q9Y6Q1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPN6Q9Y6Q1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPN6Q9Y6Q1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPN6Q9Y6Q1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPN6Q9Y6Q1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPN6Q9Y6Q1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPN6Q9Y6Q1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAPN6Q9Y6Q1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAPN6Q9Y6Q1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPN6Q9Y6Q1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAPN6Q9Y6Q1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAPN6Q9Y6Q1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAPN6Q9Y6Q1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAPN6Q9Y6Q1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAPN6Q9Y6Q1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAPN6Q9Y6Q1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAPN6Q9Y6Q1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN6Q9Y6Q1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN6Q9Y6Q1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN6Q9Y6Q1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPN6Q9Y6Q1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPN6Q9Y6Q1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPN6Q9Y6Q1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPN6Q9Y6Q1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPN6Q9Y6Q1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAPN6Q9Y6Q1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CAPN6Q9Y6Q1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPN6Q9Y6Q1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPN6Q9Y6Q1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPN6Q9Y6Q1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPN6Q9Y6Q1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPN6Q9Y6Q1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPN6Q9Y6Q1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPN6Q9Y6Q1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPN6Q9Y6Q1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPN6Q9Y6Q1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPN6Q9Y6Q1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPN6Q9Y6Q1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CAPN6Q9Y6Q1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAPN6Q9Y6Q1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAPN6Q9Y6Q1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAPN6Q9Y6Q1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAPN6Q9Y6Q1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAPN6Q9Y6Q1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CAPN6Q9Y6Q1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAPN6Q9Y6Q1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CAPN6Q9Y6Q1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAPN6Q9Y6Q1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CAPN6Q9Y6Q1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAPN6Q9Y6Q1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAPN6Q9Y6Q1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CAPN6Q9Y6Q1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CAPN6Q9Y6Q1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAPN6Q9Y6Q1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CAPN6Q9Y6Q1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms