Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y625

GPC6, Glypican-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6Q9Y625 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC6Q9Y625 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC6Q9Y625 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC6Q9Y625 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC6Q9Y625 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC6Q9Y625 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC6Q9Y625 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC6Q9Y625 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC6Q9Y625 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC6Q9Y625 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC6Q9Y625 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC6Q9Y625 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC6Q9Y625 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC6Q9Y625 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC6Q9Y625 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC6Q9Y625 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC6Q9Y625 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC6Q9Y625 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC6Q9Y625 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC6Q9Y625 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC6Q9Y625 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC6Q9Y625 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC6Q9Y625 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC6Q9Y625 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC6Q9Y625 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC6Q9Y625 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC6Q9Y625 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC6Q9Y625 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC6Q9Y625 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC6Q9Y625 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC6Q9Y625 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC6Q9Y625 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC6Q9Y625 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC6Q9Y625 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC6Q9Y625 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC6Q9Y625 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC6Q9Y625 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC6Q9Y625 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC6Q9Y625 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC6Q9Y625 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC6Q9Y625 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC6Q9Y625 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC6Q9Y625 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC6Q9Y625 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC6Q9Y625 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC6Q9Y625 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC6Q9Y625 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC6Q9Y625 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC6Q9Y625 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC6Q9Y625 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC6Q9Y625 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC6Q9Y625 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC6Q9Y625 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC6Q9Y625 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC6Q9Y625 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC6Q9Y625 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC6Q9Y625 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC6Q9Y625 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC6Q9Y625 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC6Q9Y625 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPC6Q9Y625 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC6Q9Y625 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC6Q9Y625 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC6Q9Y625 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC6Q9Y625 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC6Q9Y625 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC6Q9Y625 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC6Q9Y625 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPC6Q9Y625 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC6Q9Y625 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC6Q9Y625 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC6Q9Y625 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC6Q9Y625 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPC6Q9Y625 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC6Q9Y625 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPC6Q9Y625 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC6Q9Y625 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC6Q9Y625 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC6Q9Y625 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC6Q9Y625 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC6Q9Y625 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC6Q9Y625 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC6Q9Y625 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC6Q9Y625 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC6Q9Y625 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPC6Q9Y625 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPC6Q9Y625 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC6Q9Y625 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC6Q9Y625 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC6Q9Y625 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC6Q9Y625 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC6Q9Y625 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC6Q9Y625 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC6Q9Y625 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC6Q9Y625 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC6Q9Y625 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC6Q9Y625 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC6Q9Y625 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC6Q9Y625 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC6Q9Y625 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms