Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX5Q9Y5X3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX5Q9Y5X3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX5Q9Y5X3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX5Q9Y5X3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX5Q9Y5X3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX5Q9Y5X3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX5Q9Y5X3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX5Q9Y5X3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX5Q9Y5X3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX5Q9Y5X3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX5Q9Y5X3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX5Q9Y5X3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX5Q9Y5X3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX5Q9Y5X3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX5Q9Y5X3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX5Q9Y5X3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX5Q9Y5X3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX5Q9Y5X3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX5Q9Y5X3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX5Q9Y5X3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX5Q9Y5X3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX5Q9Y5X3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX5Q9Y5X3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX5Q9Y5X3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX5Q9Y5X3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX5Q9Y5X3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX5Q9Y5X3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX5Q9Y5X3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX5Q9Y5X3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX5Q9Y5X3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX5Q9Y5X3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX5Q9Y5X3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX5Q9Y5X3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX5Q9Y5X3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX5Q9Y5X3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX5Q9Y5X3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX5Q9Y5X3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX5Q9Y5X3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX5Q9Y5X3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX5Q9Y5X3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX5Q9Y5X3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX5Q9Y5X3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX5Q9Y5X3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX5Q9Y5X3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX5Q9Y5X3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX5Q9Y5X3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX5Q9Y5X3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX5Q9Y5X3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX5Q9Y5X3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX5Q9Y5X3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX5Q9Y5X3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX5Q9Y5X3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX5Q9Y5X3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX5Q9Y5X3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX5Q9Y5X3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX5Q9Y5X3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX5Q9Y5X3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX5Q9Y5X3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX5Q9Y5X3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX5Q9Y5X3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX5Q9Y5X3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX5Q9Y5X3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX5Q9Y5X3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX5Q9Y5X3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX5Q9Y5X3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX5Q9Y5X3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX5Q9Y5X3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX5Q9Y5X3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX5Q9Y5X3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX5Q9Y5X3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX5Q9Y5X3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX5Q9Y5X3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX5Q9Y5X3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX5Q9Y5X3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX5Q9Y5X3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX5Q9Y5X3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX5Q9Y5X3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX5Q9Y5X3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX5Q9Y5X3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX5Q9Y5X3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX5Q9Y5X3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX5Q9Y5X3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX5Q9Y5X3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX5Q9Y5X3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX5Q9Y5X3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX5Q9Y5X3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX5Q9Y5X3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX5Q9Y5X3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX5Q9Y5X3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX5Q9Y5X3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX5Q9Y5X3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX5Q9Y5X3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX5Q9Y5X3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX5Q9Y5X3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX5Q9Y5X3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX5Q9Y5X3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX5Q9Y5X3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX5Q9Y5X3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX5Q9Y5X3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms