Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
COL4A3BPQ9Y5P4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
COL4A3BPQ9Y5P4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
COL4A3BPQ9Y5P4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
COL4A3BPQ9Y5P4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
COL4A3BPQ9Y5P4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
COL4A3BPQ9Y5P4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
COL4A3BPQ9Y5P4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL4A3BPQ9Y5P4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
COL4A3BPQ9Y5P4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
COL4A3BPQ9Y5P4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
COL4A3BPQ9Y5P4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
COL4A3BPQ9Y5P4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
COL4A3BPQ9Y5P4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
COL4A3BPQ9Y5P4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
COL4A3BPQ9Y5P4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
COL4A3BPQ9Y5P4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
COL4A3BPQ9Y5P4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
COL4A3BPQ9Y5P4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
COL4A3BPQ9Y5P4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
COL4A3BPQ9Y5P4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COL4A3BPQ9Y5P4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
COL4A3BPQ9Y5P4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
COL4A3BPQ9Y5P4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
COL4A3BPQ9Y5P4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
COL4A3BPQ9Y5P4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
COL4A3BPQ9Y5P4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
COL4A3BPQ9Y5P4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
COL4A3BPQ9Y5P4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
COL4A3BPQ9Y5P4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL4A3BPQ9Y5P4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL4A3BPQ9Y5P4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL4A3BPQ9Y5P4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
COL4A3BPQ9Y5P4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
COL4A3BPQ9Y5P4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
COL4A3BPQ9Y5P4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
COL4A3BPQ9Y5P4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL4A3BPQ9Y5P4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL4A3BPQ9Y5P4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL4A3BPQ9Y5P4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL4A3BPQ9Y5P4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL4A3BPQ9Y5P4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL4A3BPQ9Y5P4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL4A3BPQ9Y5P4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL4A3BPQ9Y5P4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL4A3BPQ9Y5P4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
COL4A3BPQ9Y5P4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
COL4A3BPQ9Y5P4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL4A3BPQ9Y5P4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL4A3BPQ9Y5P4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL4A3BPQ9Y5P4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL4A3BPQ9Y5P4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL4A3BPQ9Y5P4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL4A3BPQ9Y5P4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL4A3BPQ9Y5P4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL4A3BPQ9Y5P4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL4A3BPQ9Y5P4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL4A3BPQ9Y5P4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
COL4A3BPQ9Y5P4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL4A3BPQ9Y5P4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL4A3BPQ9Y5P4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL4A3BPQ9Y5P4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
COL4A3BPQ9Y5P4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL4A3BPQ9Y5P4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL4A3BPQ9Y5P4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL4A3BPQ9Y5P4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL4A3BPQ9Y5P4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL4A3BPQ9Y5P4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL4A3BPQ9Y5P4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL4A3BPQ9Y5P4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
COL4A3BPQ9Y5P4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL4A3BPQ9Y5P4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL4A3BPQ9Y5P4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL4A3BPQ9Y5P4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL4A3BPQ9Y5P4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL4A3BPQ9Y5P4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL4A3BPQ9Y5P4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL4A3BPQ9Y5P4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL4A3BPQ9Y5P4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL4A3BPQ9Y5P4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL4A3BPQ9Y5P4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL4A3BPQ9Y5P4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL4A3BPQ9Y5P4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL4A3BPQ9Y5P4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
COL4A3BPQ9Y5P4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL4A3BPQ9Y5P4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
COL4A3BPQ9Y5P4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL4A3BPQ9Y5P4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms