Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAI2Q9Y5P3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RAI2Q9Y5P3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAI2Q9Y5P3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAI2Q9Y5P3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAI2Q9Y5P3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAI2Q9Y5P3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RAI2Q9Y5P3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAI2Q9Y5P3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAI2Q9Y5P3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAI2Q9Y5P3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAI2Q9Y5P3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAI2Q9Y5P3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAI2Q9Y5P3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RAI2Q9Y5P3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAI2Q9Y5P3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAI2Q9Y5P3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAI2Q9Y5P3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAI2Q9Y5P3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAI2Q9Y5P3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAI2Q9Y5P3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAI2Q9Y5P3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RAI2Q9Y5P3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAI2Q9Y5P3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAI2Q9Y5P3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAI2Q9Y5P3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RAI2Q9Y5P3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAI2Q9Y5P3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAI2Q9Y5P3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAI2Q9Y5P3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAI2Q9Y5P3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAI2Q9Y5P3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAI2Q9Y5P3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAI2Q9Y5P3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RAI2Q9Y5P3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAI2Q9Y5P3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAI2Q9Y5P3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAI2Q9Y5P3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAI2Q9Y5P3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAI2Q9Y5P3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAI2Q9Y5P3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAI2Q9Y5P3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAI2Q9Y5P3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAI2Q9Y5P3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
RAI2Q9Y5P3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RAI2Q9Y5P3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAI2Q9Y5P3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAI2Q9Y5P3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAI2Q9Y5P3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAI2Q9Y5P3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RAI2Q9Y5P3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAI2Q9Y5P3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAI2Q9Y5P3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAI2Q9Y5P3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAI2Q9Y5P3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAI2Q9Y5P3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAI2Q9Y5P3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAI2Q9Y5P3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAI2Q9Y5P3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAI2Q9Y5P3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAI2Q9Y5P3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAI2Q9Y5P3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAI2Q9Y5P3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAI2Q9Y5P3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAI2Q9Y5P3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAI2Q9Y5P3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAI2Q9Y5P3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAI2Q9Y5P3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAI2Q9Y5P3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAI2Q9Y5P3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAI2Q9Y5P3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAI2Q9Y5P3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAI2Q9Y5P3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAI2Q9Y5P3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAI2Q9Y5P3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAI2Q9Y5P3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAI2Q9Y5P3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAI2Q9Y5P3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAI2Q9Y5P3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAI2Q9Y5P3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAI2Q9Y5P3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAI2Q9Y5P3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAI2Q9Y5P3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAI2Q9Y5P3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAI2Q9Y5P3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAI2Q9Y5P3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAI2Q9Y5P3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAI2Q9Y5P3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAI2Q9Y5P3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAI2Q9Y5P3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAI2Q9Y5P3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAI2Q9Y5P3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAI2Q9Y5P3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RAI2Q9Y5P3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAI2Q9Y5P3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAI2Q9Y5P3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAI2Q9Y5P3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RAI2Q9Y5P3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAI2Q9Y5P3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAI2Q9Y5P3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms