Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHLDA3Q9Y5J5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PHLDA3Q9Y5J5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHLDA3Q9Y5J5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHLDA3Q9Y5J5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHLDA3Q9Y5J5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHLDA3Q9Y5J5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHLDA3Q9Y5J5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHLDA3Q9Y5J5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHLDA3Q9Y5J5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHLDA3Q9Y5J5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHLDA3Q9Y5J5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHLDA3Q9Y5J5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHLDA3Q9Y5J5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHLDA3Q9Y5J5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHLDA3Q9Y5J5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHLDA3Q9Y5J5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHLDA3Q9Y5J5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHLDA3Q9Y5J5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHLDA3Q9Y5J5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PHLDA3Q9Y5J5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHLDA3Q9Y5J5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHLDA3Q9Y5J5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHLDA3Q9Y5J5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHLDA3Q9Y5J5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHLDA3Q9Y5J5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHLDA3Q9Y5J5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHLDA3Q9Y5J5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHLDA3Q9Y5J5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHLDA3Q9Y5J5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHLDA3Q9Y5J5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHLDA3Q9Y5J5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHLDA3Q9Y5J5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHLDA3Q9Y5J5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHLDA3Q9Y5J5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHLDA3Q9Y5J5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHLDA3Q9Y5J5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHLDA3Q9Y5J5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHLDA3Q9Y5J5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHLDA3Q9Y5J5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHLDA3Q9Y5J5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHLDA3Q9Y5J5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHLDA3Q9Y5J5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHLDA3Q9Y5J5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHLDA3Q9Y5J5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHLDA3Q9Y5J5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHLDA3Q9Y5J5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHLDA3Q9Y5J5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHLDA3Q9Y5J5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PHLDA3Q9Y5J5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHLDA3Q9Y5J5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHLDA3Q9Y5J5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHLDA3Q9Y5J5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHLDA3Q9Y5J5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHLDA3Q9Y5J5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHLDA3Q9Y5J5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHLDA3Q9Y5J5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PHLDA3Q9Y5J5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHLDA3Q9Y5J5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHLDA3Q9Y5J5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PHLDA3Q9Y5J5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHLDA3Q9Y5J5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PHLDA3Q9Y5J5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHLDA3Q9Y5J5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms