Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP15Q9Y4E8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP15Q9Y4E8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP15Q9Y4E8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP15Q9Y4E8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP15Q9Y4E8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP15Q9Y4E8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP15Q9Y4E8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP15Q9Y4E8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP15Q9Y4E8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP15Q9Y4E8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP15Q9Y4E8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP15Q9Y4E8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP15Q9Y4E8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP15Q9Y4E8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP15Q9Y4E8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP15Q9Y4E8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP15Q9Y4E8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP15Q9Y4E8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP15Q9Y4E8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP15Q9Y4E8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP15Q9Y4E8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP15Q9Y4E8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP15Q9Y4E8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP15Q9Y4E8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP15Q9Y4E8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP15Q9Y4E8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP15Q9Y4E8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP15Q9Y4E8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP15Q9Y4E8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP15Q9Y4E8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP15Q9Y4E8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP15Q9Y4E8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP15Q9Y4E8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP15Q9Y4E8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP15Q9Y4E8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP15Q9Y4E8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP15Q9Y4E8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP15Q9Y4E8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP15Q9Y4E8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP15Q9Y4E8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP15Q9Y4E8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP15Q9Y4E8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP15Q9Y4E8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP15Q9Y4E8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP15Q9Y4E8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP15Q9Y4E8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP15Q9Y4E8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP15Q9Y4E8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP15Q9Y4E8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP15Q9Y4E8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP15Q9Y4E8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP15Q9Y4E8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP15Q9Y4E8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP15Q9Y4E8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP15Q9Y4E8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP15Q9Y4E8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP15Q9Y4E8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP15Q9Y4E8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP15Q9Y4E8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP15Q9Y4E8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP15Q9Y4E8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP15Q9Y4E8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP15Q9Y4E8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP15Q9Y4E8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP15Q9Y4E8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP15Q9Y4E8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP15Q9Y4E8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP15Q9Y4E8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP15Q9Y4E8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
USP15Q9Y4E8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
USP15Q9Y4E8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
USP15Q9Y4E8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
USP15Q9Y4E8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
USP15Q9Y4E8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
USP15Q9Y4E8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
USP15Q9Y4E8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
USP15Q9Y4E8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
USP15Q9Y4E8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP15Q9Y4E8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP15Q9Y4E8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP15Q9Y4E8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP15Q9Y4E8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP15Q9Y4E8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP15Q9Y4E8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP15Q9Y4E8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP15Q9Y4E8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP15Q9Y4E8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP15Q9Y4E8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP15Q9Y4E8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP15Q9Y4E8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP15Q9Y4E8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP15Q9Y4E8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP15Q9Y4E8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP15Q9Y4E8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP15Q9Y4E8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP15Q9Y4E8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP15Q9Y4E8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP15Q9Y4E8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP15Q9Y4E8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms