Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y1

POLR3K, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3KQ9Y2Y1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3KQ9Y2Y1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3KQ9Y2Y1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3KQ9Y2Y1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR3KQ9Y2Y1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR3KQ9Y2Y1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3KQ9Y2Y1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3KQ9Y2Y1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3KQ9Y2Y1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3KQ9Y2Y1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3KQ9Y2Y1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3KQ9Y2Y1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3KQ9Y2Y1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3KQ9Y2Y1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3KQ9Y2Y1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3KQ9Y2Y1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR3KQ9Y2Y1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3KQ9Y2Y1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3KQ9Y2Y1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3KQ9Y2Y1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3KQ9Y2Y1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3KQ9Y2Y1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3KQ9Y2Y1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR3KQ9Y2Y1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3KQ9Y2Y1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3KQ9Y2Y1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR3KQ9Y2Y1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3KQ9Y2Y1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3KQ9Y2Y1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3KQ9Y2Y1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3KQ9Y2Y1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3KQ9Y2Y1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3KQ9Y2Y1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR3KQ9Y2Y1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR3KQ9Y2Y1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3KQ9Y2Y1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3KQ9Y2Y1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR3KQ9Y2Y1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3KQ9Y2Y1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3KQ9Y2Y1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3KQ9Y2Y1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3KQ9Y2Y1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3KQ9Y2Y1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3KQ9Y2Y1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3KQ9Y2Y1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3KQ9Y2Y1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3KQ9Y2Y1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3KQ9Y2Y1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3KQ9Y2Y1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3KQ9Y2Y1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3KQ9Y2Y1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3KQ9Y2Y1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3KQ9Y2Y1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3KQ9Y2Y1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3KQ9Y2Y1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3KQ9Y2Y1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3KQ9Y2Y1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3KQ9Y2Y1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3KQ9Y2Y1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3KQ9Y2Y1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3KQ9Y2Y1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3KQ9Y2Y1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3KQ9Y2Y1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3KQ9Y2Y1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3KQ9Y2Y1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3KQ9Y2Y1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3KQ9Y2Y1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3KQ9Y2Y1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3KQ9Y2Y1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3KQ9Y2Y1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR3KQ9Y2Y1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR3KQ9Y2Y1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR3KQ9Y2Y1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3KQ9Y2Y1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3KQ9Y2Y1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3KQ9Y2Y1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3KQ9Y2Y1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3KQ9Y2Y1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3KQ9Y2Y1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3KQ9Y2Y1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3KQ9Y2Y1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3KQ9Y2Y1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3KQ9Y2Y1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3KQ9Y2Y1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3KQ9Y2Y1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3KQ9Y2Y1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3KQ9Y2Y1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3KQ9Y2Y1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3KQ9Y2Y1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3KQ9Y2Y1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3KQ9Y2Y1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3KQ9Y2Y1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3KQ9Y2Y1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3KQ9Y2Y1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3KQ9Y2Y1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3KQ9Y2Y1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3KQ9Y2Y1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3KQ9Y2Y1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3KQ9Y2Y1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3KQ9Y2Y1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms