Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8A1Q9Y2Q0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP8A1Q9Y2Q0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP8A1Q9Y2Q0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP8A1Q9Y2Q0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP8A1Q9Y2Q0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP8A1Q9Y2Q0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP8A1Q9Y2Q0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP8A1Q9Y2Q0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP8A1Q9Y2Q0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP8A1Q9Y2Q0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP8A1Q9Y2Q0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP8A1Q9Y2Q0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP8A1Q9Y2Q0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP8A1Q9Y2Q0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP8A1Q9Y2Q0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP8A1Q9Y2Q0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP8A1Q9Y2Q0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP8A1Q9Y2Q0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP8A1Q9Y2Q0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP8A1Q9Y2Q0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP8A1Q9Y2Q0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP8A1Q9Y2Q0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP8A1Q9Y2Q0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP8A1Q9Y2Q0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP8A1Q9Y2Q0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP8A1Q9Y2Q0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP8A1Q9Y2Q0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP8A1Q9Y2Q0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP8A1Q9Y2Q0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP8A1Q9Y2Q0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP8A1Q9Y2Q0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP8A1Q9Y2Q0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP8A1Q9Y2Q0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP8A1Q9Y2Q0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP8A1Q9Y2Q0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP8A1Q9Y2Q0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP8A1Q9Y2Q0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP8A1Q9Y2Q0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP8A1Q9Y2Q0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP8A1Q9Y2Q0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP8A1Q9Y2Q0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP8A1Q9Y2Q0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP8A1Q9Y2Q0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP8A1Q9Y2Q0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP8A1Q9Y2Q0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP8A1Q9Y2Q0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP8A1Q9Y2Q0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP8A1Q9Y2Q0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP8A1Q9Y2Q0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP8A1Q9Y2Q0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP8A1Q9Y2Q0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP8A1Q9Y2Q0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP8A1Q9Y2Q0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP8A1Q9Y2Q0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP8A1Q9Y2Q0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP8A1Q9Y2Q0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP8A1Q9Y2Q0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP8A1Q9Y2Q0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP8A1Q9Y2Q0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP8A1Q9Y2Q0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP8A1Q9Y2Q0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP8A1Q9Y2Q0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms