Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM50BQ9Y247 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM50BQ9Y247 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM50BQ9Y247 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM50BQ9Y247 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM50BQ9Y247 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM50BQ9Y247 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM50BQ9Y247 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM50BQ9Y247 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM50BQ9Y247 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
FAM50BQ9Y247 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM50BQ9Y247 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM50BQ9Y247 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM50BQ9Y247 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM50BQ9Y247 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM50BQ9Y247 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM50BQ9Y247 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM50BQ9Y247 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM50BQ9Y247 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM50BQ9Y247 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM50BQ9Y247 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM50BQ9Y247 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM50BQ9Y247 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM50BQ9Y247 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM50BQ9Y247 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FAM50BQ9Y247 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM50BQ9Y247 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM50BQ9Y247 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM50BQ9Y247 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM50BQ9Y247 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM50BQ9Y247 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM50BQ9Y247 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM50BQ9Y247 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FAM50BQ9Y247 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FAM50BQ9Y247 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM50BQ9Y247 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM50BQ9Y247 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM50BQ9Y247 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM50BQ9Y247 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM50BQ9Y247 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM50BQ9Y247 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM50BQ9Y247 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAM50BQ9Y247 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAM50BQ9Y247 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM50BQ9Y247 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM50BQ9Y247 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM50BQ9Y247 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM50BQ9Y247 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM50BQ9Y247 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM50BQ9Y247 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM50BQ9Y247 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM50BQ9Y247 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM50BQ9Y247 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM50BQ9Y247 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM50BQ9Y247 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM50BQ9Y247 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM50BQ9Y247 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM50BQ9Y247 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM50BQ9Y247 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM50BQ9Y247 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM50BQ9Y247 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM50BQ9Y247 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM50BQ9Y247 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM50BQ9Y247 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM50BQ9Y247 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM50BQ9Y247 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM50BQ9Y247 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM50BQ9Y247 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM50BQ9Y247 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM50BQ9Y247 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM50BQ9Y247 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM50BQ9Y247 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM50BQ9Y247 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM50BQ9Y247 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM50BQ9Y247 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM50BQ9Y247 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM50BQ9Y247 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM50BQ9Y247 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM50BQ9Y247 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM50BQ9Y247 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM50BQ9Y247 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
FAM50BQ9Y247 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM50BQ9Y247 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM50BQ9Y247 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM50BQ9Y247 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM50BQ9Y247 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM50BQ9Y247 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM50BQ9Y247 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM50BQ9Y247 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM50BQ9Y247 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM50BQ9Y247 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM50BQ9Y247 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM50BQ9Y247 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM50BQ9Y247 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM50BQ9Y247 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM50BQ9Y247 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM50BQ9Y247 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FAM50BQ9Y247 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM50BQ9Y247 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM50BQ9Y247 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms