Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apobec2Q9WV35 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apobec2Q9WV35 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apobec2Q9WV35 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apobec2Q9WV35 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Apobec2Q9WV35 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apobec2Q9WV35 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apobec2Q9WV35 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apobec2Q9WV35 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Apobec2Q9WV35 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Apobec2Q9WV35 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apobec2Q9WV35 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apobec2Q9WV35 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apobec2Q9WV35 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apobec2Q9WV35 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apobec2Q9WV35 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apobec2Q9WV35 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apobec2Q9WV35 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apobec2Q9WV35 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apobec2Q9WV35 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apobec2Q9WV35 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Apobec2Q9WV35 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apobec2Q9WV35 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apobec2Q9WV35 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apobec2Q9WV35 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apobec2Q9WV35 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apobec2Q9WV35 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apobec2Q9WV35 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apobec2Q9WV35 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apobec2Q9WV35 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apobec2Q9WV35 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apobec2Q9WV35 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apobec2Q9WV35 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apobec2Q9WV35 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apobec2Q9WV35 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apobec2Q9WV35 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apobec2Q9WV35 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apobec2Q9WV35 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apobec2Q9WV35 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apobec2Q9WV35 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apobec2Q9WV35 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apobec2Q9WV35 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apobec2Q9WV35 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apobec2Q9WV35 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apobec2Q9WV35 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Apobec2Q9WV35 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apobec2Q9WV35 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apobec2Q9WV35 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apobec2Q9WV35 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apobec2Q9WV35 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apobec2Q9WV35 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apobec2Q9WV35 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apobec2Q9WV35 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apobec2Q9WV35 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apobec2Q9WV35 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apobec2Q9WV35 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apobec2Q9WV35 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apobec2Q9WV35 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apobec2Q9WV35 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Apobec2Q9WV35 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apobec2Q9WV35 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apobec2Q9WV35 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apobec2Q9WV35 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apobec2Q9WV35 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apobec2Q9WV35 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Apobec2Q9WV35 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apobec2Q9WV35 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apobec2Q9WV35 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apobec2Q9WV35 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apobec2Q9WV35 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apobec2Q9WV35 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apobec2Q9WV35 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apobec2Q9WV35 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apobec2Q9WV35 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apobec2Q9WV35 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apobec2Q9WV35 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apobec2Q9WV35 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apobec2Q9WV35 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apobec2Q9WV35 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apobec2Q9WV35 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apobec2Q9WV35 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apobec2Q9WV35 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apobec2Q9WV35 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apobec2Q9WV35 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apobec2Q9WV35 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apobec2Q9WV35 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apobec2Q9WV35 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apobec2Q9WV35 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Apobec2Q9WV35 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apobec2Q9WV35 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apobec2Q9WV35 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apobec2Q9WV35 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apobec2Q9WV35 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apobec2Q9WV35 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apobec2Q9WV35 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apobec2Q9WV35 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Apobec2Q9WV35 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apobec2Q9WV35 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apobec2Q9WV35 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Apobec2Q9WV35 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms