Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atp1a4Q9WV27 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atp1a4Q9WV27 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp1a4Q9WV27 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp1a4Q9WV27 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp1a4Q9WV27 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp1a4Q9WV27 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp1a4Q9WV27 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp1a4Q9WV27 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp1a4Q9WV27 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp1a4Q9WV27 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp1a4Q9WV27 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp1a4Q9WV27 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp1a4Q9WV27 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp1a4Q9WV27 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp1a4Q9WV27 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp1a4Q9WV27 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp1a4Q9WV27 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp1a4Q9WV27 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp1a4Q9WV27 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp1a4Q9WV27 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp1a4Q9WV27 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp1a4Q9WV27 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp1a4Q9WV27 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp1a4Q9WV27 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp1a4Q9WV27 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp1a4Q9WV27 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp1a4Q9WV27 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp1a4Q9WV27 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp1a4Q9WV27 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp1a4Q9WV27 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp1a4Q9WV27 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp1a4Q9WV27 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp1a4Q9WV27 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp1a4Q9WV27 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp1a4Q9WV27 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp1a4Q9WV27 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp1a4Q9WV27 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp1a4Q9WV27 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp1a4Q9WV27 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp1a4Q9WV27 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp1a4Q9WV27 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp1a4Q9WV27 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp1a4Q9WV27 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp1a4Q9WV27 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Atp1a4Q9WV27 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp1a4Q9WV27 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp1a4Q9WV27 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp1a4Q9WV27 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp1a4Q9WV27 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp1a4Q9WV27 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp1a4Q9WV27 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp1a4Q9WV27 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp1a4Q9WV27 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp1a4Q9WV27 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp1a4Q9WV27 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp1a4Q9WV27 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Atp1a4Q9WV27 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp1a4Q9WV27 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp1a4Q9WV27 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp1a4Q9WV27 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp1a4Q9WV27 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp1a4Q9WV27 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp1a4Q9WV27 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp1a4Q9WV27 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp1a4Q9WV27 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp1a4Q9WV27 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp1a4Q9WV27 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp1a4Q9WV27 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Atp1a4Q9WV27 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp1a4Q9WV27 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp1a4Q9WV27 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp1a4Q9WV27 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp1a4Q9WV27 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp1a4Q9WV27 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp1a4Q9WV27 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp1a4Q9WV27 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp1a4Q9WV27 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp1a4Q9WV27 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp1a4Q9WV27 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp1a4Q9WV27 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp1a4Q9WV27 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp1a4Q9WV27 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp1a4Q9WV27 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp1a4Q9WV27 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp1a4Q9WV27 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp1a4Q9WV27 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp1a4Q9WV27 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp1a4Q9WV27 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp1a4Q9WV27 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp1a4Q9WV27 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp1a4Q9WV27 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp1a4Q9WV27 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp1a4Q9WV27 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp1a4Q9WV27 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp1a4Q9WV27 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp1a4Q9WV27 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp1a4Q9WV27 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp1a4Q9WV27 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp1a4Q9WV27 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms