Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Gabbr1Q9WV18 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gabbr1Q9WV18 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gabbr1Q9WV18 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gabbr1Q9WV18 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gabbr1Q9WV18 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Gabbr1Q9WV18 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gabbr1Q9WV18 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Gabbr1Q9WV18 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gabbr1Q9WV18 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gabbr1Q9WV18 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gabbr1Q9WV18 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gabbr1Q9WV18 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gabbr1Q9WV18 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gabbr1Q9WV18 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gabbr1Q9WV18 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gabbr1Q9WV18 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gabbr1Q9WV18 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gabbr1Q9WV18 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gabbr1Q9WV18 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gabbr1Q9WV18 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gabbr1Q9WV18 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gabbr1Q9WV18 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gabbr1Q9WV18 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gabbr1Q9WV18 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gabbr1Q9WV18 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gabbr1Q9WV18 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gabbr1Q9WV18 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gabbr1Q9WV18 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gabbr1Q9WV18 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gabbr1Q9WV18 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gabbr1Q9WV18 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gabbr1Q9WV18 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gabbr1Q9WV18 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gabbr1Q9WV18 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gabbr1Q9WV18 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gabbr1Q9WV18 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gabbr1Q9WV18 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gabbr1Q9WV18 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gabbr1Q9WV18 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gabbr1Q9WV18 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gabbr1Q9WV18 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gabbr1Q9WV18 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gabbr1Q9WV18 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gabbr1Q9WV18 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gabbr1Q9WV18 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Gabbr1Q9WV18 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gabbr1Q9WV18 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gabbr1Q9WV18 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gabbr1Q9WV18 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gabbr1Q9WV18 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gabbr1Q9WV18 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gabbr1Q9WV18 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gabbr1Q9WV18 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gabbr1Q9WV18 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gabbr1Q9WV18 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Gabbr1Q9WV18 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gabbr1Q9WV18 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gabbr1Q9WV18 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gabbr1Q9WV18 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gabbr1Q9WV18 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gabbr1Q9WV18 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gabbr1Q9WV18 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gabbr1Q9WV18 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Gabbr1Q9WV18 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gabbr1Q9WV18 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gabbr1Q9WV18 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gabbr1Q9WV18 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gabbr1Q9WV18 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gabbr1Q9WV18 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gabbr1Q9WV18 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gabbr1Q9WV18 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Gabbr1Q9WV18 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gabbr1Q9WV18 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gabbr1Q9WV18 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gabbr1Q9WV18 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gabbr1Q9WV18 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gabbr1Q9WV18 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gabbr1Q9WV18 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gabbr1Q9WV18 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gabbr1Q9WV18 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gabbr1Q9WV18 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gabbr1Q9WV18 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Gabbr1Q9WV18 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Gabbr1Q9WV18 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gabbr1Q9WV18 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gabbr1Q9WV18 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Gabbr1Q9WV18 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gabbr1Q9WV18 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gabbr1Q9WV18 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gabbr1Q9WV18 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gabbr1Q9WV18 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gabbr1Q9WV18 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gabbr1Q9WV18 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gabbr1Q9WV18 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gabbr1Q9WV18 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gabbr1Q9WV18 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gabbr1Q9WV18 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gabbr1Q9WV18 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gabbr1Q9WV18 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms