Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sh3bgrQ9WUZ7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sh3bgrQ9WUZ7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sh3bgrQ9WUZ7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sh3bgrQ9WUZ7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sh3bgrQ9WUZ7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sh3bgrQ9WUZ7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sh3bgrQ9WUZ7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sh3bgrQ9WUZ7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sh3bgrQ9WUZ7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Sh3bgrQ9WUZ7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sh3bgrQ9WUZ7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sh3bgrQ9WUZ7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sh3bgrQ9WUZ7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sh3bgrQ9WUZ7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sh3bgrQ9WUZ7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sh3bgrQ9WUZ7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sh3bgrQ9WUZ7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sh3bgrQ9WUZ7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sh3bgrQ9WUZ7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sh3bgrQ9WUZ7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sh3bgrQ9WUZ7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sh3bgrQ9WUZ7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sh3bgrQ9WUZ7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sh3bgrQ9WUZ7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sh3bgrQ9WUZ7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Sh3bgrQ9WUZ7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sh3bgrQ9WUZ7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sh3bgrQ9WUZ7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sh3bgrQ9WUZ7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sh3bgrQ9WUZ7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sh3bgrQ9WUZ7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sh3bgrQ9WUZ7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Sh3bgrQ9WUZ7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sh3bgrQ9WUZ7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sh3bgrQ9WUZ7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Sh3bgrQ9WUZ7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sh3bgrQ9WUZ7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sh3bgrQ9WUZ7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sh3bgrQ9WUZ7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sh3bgrQ9WUZ7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sh3bgrQ9WUZ7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sh3bgrQ9WUZ7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sh3bgrQ9WUZ7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sh3bgrQ9WUZ7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sh3bgrQ9WUZ7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sh3bgrQ9WUZ7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sh3bgrQ9WUZ7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sh3bgrQ9WUZ7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sh3bgrQ9WUZ7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sh3bgrQ9WUZ7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sh3bgrQ9WUZ7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sh3bgrQ9WUZ7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sh3bgrQ9WUZ7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sh3bgrQ9WUZ7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sh3bgrQ9WUZ7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sh3bgrQ9WUZ7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sh3bgrQ9WUZ7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms